Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14840
- Subject:
- NM_001143678.2
- Aligned Length:
- 1347
- Identities:
- 1264
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGACGGTGA-----------------AAA------CT-GAG-----GCTGCTAAGGGCACCCTCACTTACTCC 45
|||..||.|| |.| || ||| ||||| |||.||..|| |
Sbjct 1 ATGGGGGAGATGCAGGGCGCGCTGGCCAGAGCCCGGCTCGAGTCCCTGCTGC----GGCCCCGCCA-------C 63
Query 46 AGGATGAGGGGCATGGTG----------GCAATTCTCATC---------------GCTTTCATGAAGCAGAGGA 94
|..|.|||||.|..||.| ||.|.|| |.|| |||||||||||||||||||
Sbjct 64 AAAAAGAGGGCCGAGGCGCAGAAAAGGAGCGAGTC-CTTCCTGCTGAGCGGACTGGCTTTCATGAAGCAGAGGA 136
Query 95 GGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCC 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 GGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCC 210
Query 169 ATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 ATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCA 284
Query 243 GCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAA 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 GCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAA 358
Query 317 AGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAG 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAG 432
Query 391 AAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAA 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 AAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAA 506
Query 465 GCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTA 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 GCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTA 580
Query 539 ATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCT 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCT 654
Query 613 GAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCAGAGAATATTTT 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCAGAGAATATTTT 728
Query 687 GCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATTGAACACAACAGCACAA 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 GCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATTGAACACAACAGCACAA 802
Query 761 CATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGACAGGACTGTG 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGACAGGACTGTG 876
Query 835 GACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGC 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGC 950
Query 909 TGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAATTCCGCAAGACACCTCC 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 TGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAATTCCGCAAGACACCTCC 1024
Query 983 TGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAGATTAAGAGTCAT 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 TGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAGATTAAGAGTCAT 1098
Query 1057 GTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAG 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAG 1172
Query 1131 TGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCC 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 TGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCC 1246
Query 1205 CTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCC 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCC 1320
Query 1279 ACGGACTCTTTCCTC 1293
|||||||||||||||
Sbjct 1321 ACGGACTCTTTCCTC 1335