Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14840
- Subject:
- NM_001161848.2
- Aligned Length:
- 1293
- Identities:
- 1081
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCTAAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTCTCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCA 148
|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||||||
Sbjct 1 -------ATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATGCA 67
Query 149 AACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCT 222
|||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 68 AACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCTCT 141
Query 223 CCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCA 296
|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 142 CCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTTCA 215
Query 297 CTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCT 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 216 CTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATTCT 289
Query 371 ATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAAT 444
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 290 ATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGAAT 363
Query 445 GTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||
Sbjct 364 GTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTCTA 437
Query 519 CTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCAC 592
|||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 438 CTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACCAC 511
Query 593 GGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGAC 666
|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 512 GGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAGAC 585
Query 667 TTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAA 740
||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 586 TTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAGAA 659
Query 741 CATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGC 814
.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 660 TATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAAGC 733
Query 815 AGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCT 888
||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 734 AGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCCCG 807
Query 889 TTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTAC 962
|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 808 TTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATTAC 881
Query 963 AAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACT 1036
|||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct 882 AAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGACT 955
Query 1037 TCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCC 1110
|.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 956 TTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACACCC 1029
Query 1111 CCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCC 1184
||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1030 CCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTCCC 1103
Query 1185 CAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAG 1258
||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1104 CAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCTCG 1177
Query 1259 GCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1293
||||.||||||||.|||||...|||.||.||||||
Sbjct 1178 GCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC 1212