Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14840
- Subject:
- NM_001161849.2
- Aligned Length:
- 1297
- Identities:
- 1111
- Gaps:
- 50
Alignment
Query 1 ATGACGGTGAAAACTGAGG----CTGCTAAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTC 70
.||||| |||| || ||||..| |||| |||.||
Sbjct 1 ------ATGAAA---GAGGAGACCT--TAAGATC-CCCT--------------------------TGGAAA--- 33
Query 71 TCATCGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCA 144
|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||
Sbjct 34 -----GCTTTTATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCA 102
Query 145 TGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCC 218
|||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 103 TGCAAACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCC 176
Query 219 TTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACT 292
.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 177 CTCTCCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACT 250
Query 293 TTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTG 366
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 251 TTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTA 324
Query 367 TTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCG 440
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 325 TTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCG 398
Query 441 GAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAAT 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..
Sbjct 399 GAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGC 472
Query 515 TGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAA 588
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 473 TCTACTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAA 546
Query 589 CCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAG 662
|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 547 CCACGGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAG 620
Query 663 AGACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGG 736
||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 621 AGACTTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAG 694
Query 737 AGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCAT 810
||||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 695 AGAATATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCAT 768
Query 811 AAGCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCC 884
||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 769 AAGCAGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCC 842
Query 885 GCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATA 958
.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 843 CCCGTTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATA 916
Query 959 TTACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGAT 1032
|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||
Sbjct 917 TTACAAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGAT 990
Query 1033 GACTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTAC 1106
|||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 991 GACTTTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTAC 1064
Query 1107 TCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTG 1180
.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1065 ACCCCCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGG 1138
Query 1181 TCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTC 1254
||||||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1139 TCCCCAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTC 1212
Query 1255 CTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1293
||.|||||.||||||||.|||||...|||.||.||||||
Sbjct 1213 CTCGGCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC 1251