Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14840
- Subject:
- NM_001161850.2
- Aligned Length:
- 1350
- Identities:
- 1133
- Gaps:
- 72
Alignment
Query 1 ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCTAAGGGCACCCTCACT-------------------TACTCCAGG------- 48
||| ||.|| ||.|| |||||.|.||..|| |.|||| ||
Sbjct 1 ATG--GGCGA-----GATGC-----AGGGCGCGCTGGCTCGGGCTCGGCTCGAGTCCCTGCTCC-GGCCCCGCC 61
Query 49 ---ATGAG-GGGCATGGTGGC----AA-----------------TTCTCA------TCGCTTTCATGAAGCAGA 91
|..|| |||| ||.||| || |.||.| |.|||||.|||||.||||
Sbjct 62 ACAAAAAGCGGGC--GGAGGCTCAGAAAAGGAGCGAGTCCGTCCTGCTGAGCGGACTGGCTTTTATGAAACAGA 133
Query 92 GGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACACCCTGAAGTTCAG 165
|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 134 GAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATGCAAACACGCTGAAGTTCAG 207
Query 166 TCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACCAAGTCCTTC 239
|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 208 TCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCTCTCCTCCGCCAAGTCCCTC 281
Query 240 TCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCG 313
|||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 TCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCG 355
Query 314 GAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTA 387
||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 356 GAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATTCTATGCAGTCAAAGTTTTA 429
Query 388 CAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGT 461
|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 CAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGT 503
Query 462 GAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACA 535
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 504 GAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTCTACTTTGTCCTGGACTACA 577
Query 536 TTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGTTTCTATGCT 609
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 578 TTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGATTCTACGCA 651
Query 610 GCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCAGAGAATAT 683
||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 652 GCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCTGAGAATAT 725
Query 684 TTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATTGAACACAACAGCA 757
|.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.|.|
Sbjct 726 TCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAGAATATTGAGCATAACGGGA 799
Query 758 CAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGACAGGACT 831
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.
Sbjct 800 CAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAAGCAGCCGTATGACCGGACG 873
Query 832 GTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACAC 905
||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 874 GTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCCCGTTTTATAGCCGGAACAC 947
Query 906 AGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAATTCCGCAAGACACC 979
.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 948 GGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATTACAAACTCGGCAAGGCACC 1021
Query 980 TCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAGATTAAGAGT 1053
|||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1022 TCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGACTTTATGGAGATTAAGAGT 1095
Query 1054 CATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAACCCAAATGT 1127
|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1096 CATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACACCCCCATTTAACCCAAATGT 1169
Query 1128 GAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCAAGT 1201
|||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||.||||.||
Sbjct 1170 GAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTCCCCAGCTCCATCGGCAGGT 1243
Query 1202 CCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCT 1275
|||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1244 CCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCTCGGCTTCTCCTATGCACCT 1317
Query 1276 CCCACGGACTCTTTCCTC 1293
||...|||.||.||||||
Sbjct 1318 CCTGTGGATTCCTTCCTC 1335