Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14845
• Subject: NM_001025395.2
• Aligned Length: 1612
• Identities: 1452
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC  147
            |||    ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct   75  CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG  144

Query  148  CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  218
            ||||||||.|||||||   |.||||||   ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  215

Query  219  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA  292
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  216  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC  289

Query  293  GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACACAGAGGGAGACTGGTGG  366
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACAGAGGGAGACTGGTGG  363

Query  367  CTGGCCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCA  440
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CTGGCACACTCGCTGAGCACGGGACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCA  437

Query  441  GGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGA  514
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  438  GGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCAAGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGA  511

Query  515  GAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAAC  588
            |||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  512  GAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAGAGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAAT  585

Query  589  GCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCAC  662
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GCCAAGGGCCTAAATGTGAAACACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCAC  659

Query  663  CCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCA  736
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  660  CCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTA  733

Query  737  CCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTG  810
            ||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  734  CCGTATGTCCCACATCCAAGCCTCAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTG  807

Query  811  CGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGT  884
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  808  CGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGT  881

Query  885  GGCCATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGC  958
            .|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  882  TGCCATCAAAACTCTGAAGCCAGGCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAAC  955

Query  959  TGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATG  1032
            |||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  956  TGAGGCACGAGAAACTGGTGCAGCTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATG  1029

Query 1033  AGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACAT  1106
            |.||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1030  AACAAGGGGAGTCTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACAT  1103

Query 1107  GGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCA  1180
            |.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1104  GTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCATGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCA  1177

Query 1181  ACATCCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCATTGAAGACAATGAG  1254
            |.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1178  ATATCCTAGTAGGGGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAA  1251

Query 1255  TACACGGCGCGGCAAGGTGCCAAATTCCCCATCAAGTGGACGGCTCCAGAAGCTGCCCTCTATGGCCGCTTCAC  1328
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.|.|||||
Sbjct 1252  TACACAGCCCGGCAAGGTGCCAAATTCCCCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTACGGCAGGTTCAC  1325

Query 1329  CATCAAGTCGGACGTGTGGTCCTTCGGGATCCTGCTGACTGAGCTCACCACAAAGGGACGGGTGCCCTACCCTG  1402
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 1326  CATCAAGTCGGATGTGTGGTCCTTTGGGATTCTGCTGACCGAGCTCACCACTAAGGGAAGAGTGCCCTATCCTG  1399

Query 1403  GGATGGTGAACCGCGAGGTGCTGGACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCCTGCCCGCCGGAGTGTCCCGAG  1476
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1400  GGATGGTGAACCGTGAGGTTCTGGACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAG  1473

Query 1477  TCCCTGCACGACCTCATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGC  1550
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  TCCCTGCATGACCTTATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGC  1547

Query 1551  CTTCCTGGAGGACTACTTCACGTCCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTC  1608
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1548  CTTCCTGGAAGACTACTTTACGTCCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA  1605