Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14845
- Subject:
- XM_006499066.2
- Aligned Length:
- 1663
- Identities:
- 1452
- Gaps:
- 62
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA 74
Query 75 CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC 147
||| ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 75 CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG 144
Query 148 CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 218
||||||||.||||||| |.|||||| ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 215
Query 219 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA 292
|||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 216 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC 289
Query 293 GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC---------------- 350
||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 290 GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACGAGGAAGGTGGATGTC 363
Query 351 -----------------------------------AGAGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGG 389
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 364 AGCCAGACCTGGTTCACATTCAGATGGCTGCAAAGAGAGGGAGACTGGTGGCTGGCACACTCGCTGAGCACGGG 437
Query 390 ACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCA 463
||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 438 ACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCA 511
Query 464 AGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAA 537
|||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct 512 AGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAG 585
Query 538 AGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCA 611
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 586 AGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAATGCCAAGGGCCTAAATGTGAAACA 659
Query 612 CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC 685
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC 733
Query 686 TGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCG 759
|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 734 TCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTACCGTATGTCCCACATCCAAGCCT 807
Query 760 CAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA 833
|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA 881
Query 834 GGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTG 907
|||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 882 GGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGTTGCCATCAAAACTCTGAAGCCAG 955
Query 908 GCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAG 981
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 956 GCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAACTGAGGCACGAGAAACTGGTGCAG 1029
Query 982 TTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTT 1055
.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1030 CTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATGAACAAGGGGAGTCTGCTGGACTT 1103
Query 1056 TCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCA 1129
||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1104 TCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACATGTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCA 1177
Query 1130 TGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTG 1203
||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1178 TGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCAATATCCTAGTAGGGGAGAACCTG 1251
Query 1204 GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCATTGAAGACAATGAGTACACGGCGCGGCAAGGTGCCAA 1277
||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1252 GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAATACACAGCCCGGCAAGGTGCCAA 1325
Query 1278 ATTCCCCATCAAGTGGACGGCTCCAGAAGCTGCCCTCTATGGCCGCTTCACCATCAAGTCGGACGTGTGGTCCT 1351
||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1326 ATTCCCCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTACGGCAGGTTCACCATCAAGTCGGATGTGTGGTCCT 1399
Query 1352 TCGGGATCCTGCTGACTGAGCTCACCACAAAGGGACGGGTGCCCTACCCTGGGATGGTGAACCGCGAGGTGCTG 1425
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1400 TTGGGATTCTGCTGACCGAGCTCACCACTAAGGGAAGAGTGCCCTATCCTGGGATGGTGAACCGTGAGGTTCTG 1473
Query 1426 GACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCCTGCCCGCCGGAGTGTCCCGAGTCCCTGCACGACCTCATGTGCCA 1499
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1474 GACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCCTGCATGACCTTATGTGCCA 1547
Query 1500 GTGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAGGACTACTTCACGT 1573
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1548 GTGCTGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAAGACTACTTTACGT 1621
Query 1574 CCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTC 1608
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1622 CCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA 1656