Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14856
- Subject:
- XM_006537948.3
- Aligned Length:
- 1818
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 471
Alignment
Query 1 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA 444
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1 --------------------ATGAGCTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTACCTGCACAGCATGCAG 54
Query 445 CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT 518
|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 55 CCCAAAGCGCTGATTCACAGGGACCTCAAGCCTCCAAACTTGCTGCTGGTTGCAGGAGGGACAGTTCTAAAAAT 128
Query 519 TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 129 CTGCGATTTTGGTACAGCTTGTGACATCCAAACACACATGACCAATAATAAAGGGAGTGCTGCTTGGATGGCGC 202
Query 593 CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG 666
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 203 CTGAAGTATTTGAAGGTAGCAATTACAGTGAAAAGTGTGATGTCTTCAGCTGGGGTATTATCCTCTGGGAAGTG 276
Query 667 ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC 740
|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 277 ATAACACGCCGGAAACCCTTCGATGAGATCGGTGGCCCAGCTTTCAGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGCAC 350
Query 741 TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 351 TCGACCACCACTGATCAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCTTGATGACACGCTGTTGGTCTAAGGACCCAT 424
Query 815 CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 425 CTCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTCCCAGGAGCGGATGAG 498
Query 889 CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA 962
||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 499 CCGTTACAGTATCCTTGTCAGTACTCTGATGAAGGGCAGAGCAACTCAGCCACCAGCACAGGCTCATTCATGGA 572
Query 963 CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA 1036
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 573 CATTGCTTCTACAAATACCAGTAATAAAAGTGACACAAATATGGAACAGGTTCCTGCCACAAACGACACTATTA 646
Query 1037 AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC 1110
|.|||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 647 AACGCTTGGAGTCAAAACTTTTGAAAAACCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGCCTGAGCTTGGGAGCC 720
Query 1111 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TCTCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCCACTTCCGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 794
Query 1185 AGAAGCTAGGATC------------GCC-------------------------------------------GCA 1203
||||||.|||||| ||| |||
Sbjct 795 AGAAGCCAGGATCGTGGCGACTGCAGCCTATTCCAAGCCTAAACGGGGCCACCGTAAAACCGCTTCATTTGGCA 868
Query 1204 AC-----------------------CA---CAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 1251
|| || ||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 ACATTCTGGATGTCCCTGAGATCGTCATATCAGGTAACGGGCAACCAAGGCGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 942
Query 1252 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGG 1325
||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 943 GTTACTGGGACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGCCGGTCATCCAGCCCTAGTGTCAGAATGATCACTACCTCAGG 1016
Query 1326 ACCAACCTCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATA 1399
||||||||||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1017 ACCAACCTCAGAGAAGCCAGCTCGCAGTCACCCGTGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGCTCAGATA 1090
Query 1400 ACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1473
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 ACTCCATCCCAATGGCGTATCTTACACTGGATCACCAGCTACAGCCTCTAGCGCCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1164
Query 1474 TCTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTT 1547
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1165 TCCATGGCAGTGTTCGAACAACATTGTAAAATGGCACAGGAGTATATGAAAGTTCAAACCGAAATCGCATTGTT 1238
Query 1548 ATTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGG 1621
|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1239 ACTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAATTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGTCTGG 1312
Query 1622 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1695
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTATTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1386
Query 1696 GAGGTCATCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1737
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 GAGGTCATCAGAAGCCAACAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1428
