Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14870
- Subject:
- XM_011528245.1
- Aligned Length:
- 3561
- Identities:
- 3560
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCATGGCTGCCAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCATGGCTGCCAT 74
Query 75 GGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCAGTGAGTCAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCAGTGAGTCAT 148
Query 149 CGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTCAATCTCTTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTCAATCTCTTT 222
Query 223 GCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGATGCAAGCCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGATGCAAGCCT 296
Query 297 GATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC 370
Query 371 GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA 444
Query 445 TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA 518
Query 519 GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC 592
Query 593 ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT 666
Query 667 ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC 740
Query 741 GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA 814
Query 815 CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT 888
Query 889 GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC 962
Query 963 TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA 1036
Query 1037 ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG 1110
Query 1111 GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT 1184
Query 1185 CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG 1258
Query 1259 TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG 1332
Query 1333 ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG 1406
Query 1407 CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC 1480
Query 1481 CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC 1554
Query 1555 TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA 1628
Query 1629 CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC 1702
Query 1703 GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG 1776
Query 1777 TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA 1850
Query 1851 GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA 1924
Query 1925 AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC 1998
Query 1999 CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA 2072
Query 2073 GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC 2146
Query 2147 AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC 2220
Query 2221 CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG 2294
Query 2295 CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA 2368
Query 2369 GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT 2442
Query 2443 CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC 2516
Query 2517 ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC 2590
Query 2591 GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC 2664
Query 2665 CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT 2738
Query 2739 GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC 2812
Query 2813 CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC 2886
Query 2887 AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG 2960
Query 2961 AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG 3034
Query 3035 CCTATCTGCACTCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG 3108
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCTATCTGCACGCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG 3108
Query 3109 GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG 3182
Query 3183 GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT 3256
Query 3257 CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG 3330
Query 3331 CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC 3404
Query 3405 ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC 3478
Query 3479 CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC 3552
Query 3553 AGCGTGTGC 3561
|||||||||
Sbjct 3553 AGCGTGTGC 3561