Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14870
- Subject:
- XM_011528247.1
- Aligned Length:
- 3561
- Identities:
- 3263
- Gaps:
- 297
Alignment
Query 1 ATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCATGGCTGCCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCAGTGAGTCAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTCAATCTCTTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGATGCAAGCCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -ATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC 73
Query 371 GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA 147
Query 445 TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA 221
Query 519 GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC 295
Query 593 ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT 369
Query 667 ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC 443
Query 741 GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA 517
Query 815 CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT 591
Query 889 GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC 665
Query 963 TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA 739
Query 1037 ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG 813
Query 1111 GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT 887
Query 1185 CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG 961
Query 1259 TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG 1035
Query 1333 ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG 1109
Query 1407 CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC 1183
Query 1481 CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC 1257
Query 1555 TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA 1331
Query 1629 CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC 1405
Query 1703 GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG 1479
Query 1777 TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA 1553
Query 1851 GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA 1627
Query 1925 AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC 1701
Query 1999 CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA 1775
Query 2073 GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC 1849
Query 2147 AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC 1923
Query 2221 CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG 1997
Query 2295 CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA 2071
Query 2369 GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT 2145
Query 2443 CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC 2219
Query 2517 ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC 2293
Query 2591 GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC 2367
Query 2665 CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT 2441
Query 2739 GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC 2515
Query 2813 CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC 2589
Query 2887 AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG 2663
Query 2961 AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG 2737
Query 3035 CCTATCTGCACTCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG 3108
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 CCTATCTGCACGCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG 2811
Query 3109 GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG 2885
Query 3183 GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT 2959
Query 3257 CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG 3033
Query 3331 CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC 3107
Query 3405 ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC 3181
Query 3479 CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC 3255
Query 3553 AGCGTGTGC 3561
|||||||||
Sbjct 3256 AGCGTGTGC 3264