Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14870
• Subject: XR_001753750.1
• Aligned Length: 4027
• Identities: 3442
• Gaps: 584

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACTATATTGAAACATTACAACCATCTTTTGATGGCAACACCCTGAGGACCTCCCTTTTCCAGATGGGGAAACTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGGCCCAGAATTGCTAAGTGGCTTGCTTGAGTTGACACAGGGAGCTCCAGGACTCACCCTCAGCTGAGCCACCT  148

Query    1  ---------ATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCAT  65
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCGGGAGCATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCAT  222

Query   66  GGCTGCCATGGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCA  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTGCCATGGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCA  296

Query  140  GTGAGTCATCGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTC  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGAGTCATCGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTC  370

Query  214  AATCTCTTTGCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGA  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTCTTTGCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGA  444

Query  288  TGCAAGCCTGATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGG  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCAAGCCTGATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGG  518

Query  362  CTGTGTACCGTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGAC  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGTGTACCGTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGAC  592

Query  436  CCAGCCTCATTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCT  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCCTCATTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCT  666

Query  510  GTCGACCGAGGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCG  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCGACCGAGGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCG  740

Query  584  CTCTCCGCCATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTCCGCCATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTC  814

Query  658  CGCCGGCATATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGA  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCCGGCATATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGA  888

Query  732  CTTCCAGCCGGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCC  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCCAGCCGGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCC  962

Query  806  GCTTCGGCACAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATC  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTTCGGCACAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATC  1036

Query  880  CGGGACAGTGGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGT  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGGACAGTGGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGT  1110

Query  954  GACAGGCACTGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAGGCACTGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCA  1184

Query 1028  GTGGCAGGAACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGAC  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGGCAGGAACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGAC  1258

Query 1102  AGGCCGCGGGAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTG  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGCCGCGGGAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTG  1332

Query 1176  TGTCAGCATCCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTCAGCATCCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCG  1406

Query 1250  TGTCGCTGGTGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCA  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTCGCTGGTGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCA  1480

Query 1324  CGGCTGGTGATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCC  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGGCTGGTGATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCC  1554

Query 1398  CGAGGACGGCCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTA  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGAGGACGGCCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTA  1628

Query 1472  GCCAGGCACCAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTG  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCAGGCACCAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTG  1702

Query 1546  CTGGAGGGCTGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGC  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGAGGGCTGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGC  1776

Query 1620  CGGGGATGACTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGC  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGGGGATGACTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGC  1850

Query 1694  GGGGGGCTCGGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATC  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGGGGCTCGGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATC  1924

Query 1768  ACCCAGCTGTCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGG  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCCAGCTGTCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGG  1998

Query 1842  GGACCCTGAGGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAG  1915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGACCCTGAGGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAG  2072

Query 1916  TGGTGCTCAAAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGC  1989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGGTGCTCAAAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGC  2146

Query 1990  CAGGTCTCCCACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGA  2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGGTCTCCCACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGA  2220

Query 2064  GTACGTGGAGCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGG  2137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTACGTGGAGCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGG  2294

Query 2138  TGGTGGCCCAGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGC  2211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGGTGGCCCAGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGC  2368

Query 2212  CGGAACATCCTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGT  2285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CGGAACATCCTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGT  2442

Query 2286  GGGCCTGGGCGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTG  2359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GGGCCTGGGCGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTG  2516

Query 2360  GGGCCAACAGCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGA  2433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGGCCAACAGCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGA  2590

Query 2434  GAGGCCCCTCTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCC  2507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GAGGCCCCTCTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCC  2664

Query 2508  CTCCTGCCCACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCA  2581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTCCTGCCCACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCA  2738

Query 2582  CCATCCTGCGTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCG  2655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCATCCTGCGTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCG  2812

Query 2656  GCGTCGGACCCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAA  2729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GCGTCGGACCCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAA  2886

Query 2730  GGTCAGCTTGTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAG  2803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GGTCAGCTTGTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAG  2960

Query 2804  ACTGCGGCCCCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATC  2877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ACTGCGGCCCCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATC  3034

Query 2878  ATCAAGTACAAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGG  2951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATCAAGTACAAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGG  3108

Query 2952  CAGCCTCCGAGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCG  3025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CAGCCTCCGAGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCG  3182

Query 3026  AGGGCATGGCCTATCTGCACTCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAAC  3099
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGGGCATGGCCTATCTGCACGCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAAC  3256

Query 3100  GACAGGCTGGTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCG  3173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GACAGGCTGGTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCG  3330

Query 3174  CGAGGATGGGGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAG  3247
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 3331  CGAGGATGGGGACAGCCCCGTGTTCT------------------------------------------------  3356

Query 3248  ATGTCTGGTCCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAA  3321
                                                                                  ||||
Sbjct 3357  ----------------------------------------------------------------------GAAA  3360

Query 3322  TTCCTTGAGCTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGA  3395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361  TTCCTTGAGCTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGA  3434

Query 3396  GAGGCTGCCACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGT  3469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3435  GAGGCTGCCACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGT  3508

Query 3470  CCTTTCGCCCAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCT  3543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3509  CCTTTCGCCCAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCT  3582

Query 3544  TCAGTGTTCAGCGTGTGC--------------------------------------------------------  3561
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct 3583  TCAGTGTTCAGCGTGTGCTGAGGCACAATGGCAGCCCTGCCTGGGAGGACTGGACCAGGCAGTGGCTGCAGAGG  3656

Query 3562  --------------------------------------------------------------------------  3561
                                                                                      
Sbjct 3657  GAGCCTCCTGCTCCCTGCTCCAGGATGAAACCAAGAGGGGGATGTCAGCCTCACCCACACCGTGTGCCTTACTC  3730

Query 3562  --------------------------------------------------------------------------  3561
                                                                                      
Sbjct 3731  CTGTCTAGAGACCCCACCTCTGTGAACTTATTTTTCTTTCTTGGCCGTGAGCCTAACCATGATCTTGAGGGACC  3804

Query 3562  --------------------------------------------------------------------------  3561
                                                                                      
Sbjct 3805  CAACATTTGTAGGGGCACTAATCCAGCCCTTAAATCCCCCAGCTTCCAAACTTGAGGCCCACCATCTCCACCAT  3878

Query 3562  -------------------------------  3561
                                           
Sbjct 3879  CTGGTAATAAACTCATGTTTTCTCTGCTGGA  3909