Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14891
- Subject:
- NM_008847.3
- Aligned Length:
- 1644
- Identities:
- 1303
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGGCCTCCTCCGGGCCGTCGTCTTCGGTCGGTTTTTCATCCTTTGATCCCGCGGTCCCTTCCTGTAC 74
||||||||.||||||||.|||||..|| .|||.|||.|||||||||.|||||.|||.||.||||.|..||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCGCCTCCTCAGGGCCAGCG---GCGGCCGGGTTTTCATCCCTTGATGCCGGGGCCCCTGCTGGTAC 71
Query 75 CTTGTCCTCAGCATCTGGAATCAAGAGACCCATGGCATCTGAGGTGCCTTATGCCTCTGGCATGCCCATCAAGA 148
| .|..||||||||||||||||||||.|||..|.||||||||..||||..|||||||.||||||..|.||.|
Sbjct 72 C---GCAGCAGCATCTGGAATCAAGAGAGCCACAGTATCTGAGGGACCTTCCGCCTCTGTCATGCCTGTTAAAA 142
Query 149 AAATAGGCCATAGAAGTGTTGATTCCTCAGGAGAGACAACATATAAAAAGACAACCTCATCAGCCTTGAAAGGT 222
|||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 143 AAATAGGCCATCGAAGTGTTGATTCCTCTGGAGAGACTACATACAAGAAGACAACTTCATCAGCCTTGAAAGGT 216
Query 223 GCCATCCAGTTAGGCATTACCCACACTGTGGGGAGCCTGAGTACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA 296
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 GCCATCCAGTTAGGCATCACTCACACTGTGGGCAGCCTGAGCACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA 290
Query 297 TTTCTACGTGGTTGAGAGTATCTTCTTTCCCAGTGAAGGGAGCAACCTGACCCCTGCTCATCACTACAATGACT 370
.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 291 CTTCTACGTGGTGGAGAGCATCTTTTTCCCCAGTGAAGGCAGCAACCTGACACCGGCTCACCATTACAATGACT 364
Query 371 TTCGTTTCAAGACCTATGCACCTGTTGCCTTCCGCTACTTCCGGGAGCTATTTGGTATCCGGCCCGATGATTAC 444
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 365 TTCGATTCAAGACCTATGCGCCTGTTGCCTTCCGTTACTTCAGAGAGCTCTTTGGCATCCGGCCTGATGATTAC 438
Query 445 TTGTATTCCCTCTGCAGTGAGCCGCTGATTGAACTCTGTAGCTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTATTCTATGTGTC 518
|||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||..|..||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 439 TTGTACTCCCTTTGCAGTGAGCCATTGATTGAACTCTCCAATTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTCTTCTATGTGTC 512
Query 519 CAGCGACGATGAGTTCATTATTAAGACAGTCCAACATAAAGAGGCGGAATTTCTGCAGAAGCTGCTTCCAGGAT 592
|||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 513 CAGTGATGATGAATTCATCATTAAGACCGTCCAGCATAAAGAAGCAGAATTTCTGCAGAAGTTGCTTCCAGGAT 586
Query 593 ACTACATGAACCTCAACCAGAACCCTCGGACTTTGCTGCCTAAATTCTATGGACTGTACTGTGTGCAGGCAGGT 666
||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||.
Sbjct 587 ACTACATGAATCTTAACCAAAACCCTCGTACTTTGCTGCCCAAATTTTATGGATTGTACTGTGTGCAAGCAGGC 660
Query 667 GGCAAGAACATTCGGATTGTGGTGATGAACAATCTTTTACCAAGATCGGTAAAAATGCATATCAAATATGACCT 740
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 661 GGCAAGAACATACGAATTGTGGTGATGAACAATCTCTTGCCTCGGTCAGTCAAAATGCATATGAAATATGACCT 734
Query 741 CAAAGGCTCAACCTACAAACGGCGGGCTTCCCAGAAAGAGCGAGAGAAGCCTCTTCCCACATTTAAAGACCTAG 814
.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 735 GAAGGGTTCAACTTACAAGCGGCGGGCTTCTCAGAAAGAACGAGAGAAAACTCTCCCCACCTTTAAAGACCTGG 808
Query 815 ACTTCTTACAAGACATCCCTGATGGTCTTTTTTTGGATGCTGACATGTACAACGCTCTCTGTAAGACCCTGCAG 888
|||||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 809 ACTTCCTACAAGATATCCCTGACGGCCTATTTTTGGATGCTGACATGTACAGTGCTCTGTGTAAGACTCTACAG 882
Query 889 CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGATTATAGCCTCTTGATGTCAATCCATAATATAGATCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct 883 CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGACTACAGCCTGTTGATGTCCATCCACAACATGGACCA 956
Query 963 TGCACAACGAGAGCCCTTAAGCAGTGAAACACAGTACTCAGTTGATACTCGAAGACCGGCCCCCCAAAAGGCTC 1036
||||||..|.||||||...||||.|||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 957 TGCACAGAGGGAGCCCACGAGCAATGACACACAGTACTCGGCTGACACGCGCAGACCAGCCCCACAGAAGGCGC 1030
Query 1037 TGTATTCCACAGCCATGGAATCCATCCAGGGAGAGGCTCGACGGGGTGGTACCATGGAGACTGATGACCATATG 1110
|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1031 TCTATTCCACAGCTATGGAATCCATCCAGGGCGAGGCTCGACGGGGCGGCACTGTGGAGACTGAGGACCACATG 1104
Query 1111 GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAGTAAAGGGGAAAGGCTTCTGCTTTATATTGGCATCATTGACATTCTACAGTC 1184
||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1105 GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAACAAAGGAGAAAGGCTCCTGCTTTATATTGGCATCATTGATATTCTTCAGTC 1178
Query 1185 TTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCCCTGGTACATGACGGAGACACTGTCTCAGTGCATC 1258
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1179 CTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCACTGGTCCATGATGGGGATACGGTGTCAGTGCATC 1252
Query 1259 GCCCAGGCTTCTACGCTGAACGGTTCCAGCGCTTCATGTGCAACACAGTATTTAAGAAGATTCCCT----GC-- 1326
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||
Sbjct 1253 GTCCAGGCTTCTATGCTGAGCGGTTCCAGCGTTTCATGTGCAACACAGTGTTCAAGAAGATTCCCTTGAAGCCT 1326
Query 1327 -------------------------------------------------------------------------- 1326
Sbjct 1327 TCTCCTACCAAAAAGTTTCGGTCTGGCCCGTCTTTCTCTCGGCGATCAGGCCCCAGCGGCAACTCCTGCACCTC 1400
Query 1327 ----------------------------------------------------------------GTTCACCTTG 1336
||.|||||||
Sbjct 1401 CCAGCTGATGGCCTCTGGGGAACACAGAGCACAAGTGACCACCAAGGCGGAAGTGGAGCCAGATGTACACCTTG 1474
Query 1337 GTCGTCCTGATGTTTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATCAGTGAGGGCTCGCCTATTCCTGACCCCAGT 1410
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||||.|||||||
Sbjct 1475 GGCGTCCTGATGTCTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATAAGTGAGGGTTCACCTGTTCCTGGCCCCAGT 1548
Query 1411 TTCTCACCTCTAGTTGGAGAGACTTTGCAAATGCTAACTACAAGTACAACCTTGGAAAAGCTTGAAGTTGCAGA 1484
|||||||||.||||||||.|..||||||||||.||||.|...|||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1549 TTCTCACCTGTAGTTGGACAACCTTTGCAAATACTAAATTTGAGTTCAACCTTGGAAAAGCTTGATGTTGCAGA 1622
Query 1485 GTCAGAGTTCACCCAT 1500
|||||||||||||||.
Sbjct 1623 GTCAGAGTTCACCCAC 1638