Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14892
• Subject: XM_006717300.2
• Aligned Length: 1742
• Identities: 1520
• Gaps: 217

Alignment

Query    1  ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAGACACA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct    1  ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAG-----  69

Query   75  AGTGAAAAACCAAATCCTGTCTCGTTTACCCAAGATTCCGTGTACATTCATTCAAGCATGGACCAACACAGAGA  148
                                                                                      
Sbjct   70  --------------------------------------------------------------------------  69

Query  149  TGATTACGTTGCTAGCCTGTTATTACTTCAGATCAGTTTCAACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG  222
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  -----------------------------------------ACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG  102

Query  223  CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT  176

Query  297  GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA  250

Query  371  AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC  324

Query  445  ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA  398

Query  519  TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA  472

Query  593  ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT  546

Query  667  ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC  620

Query  741  AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC  694

Query  815  AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC  768

Query  889  CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA  842

Query  963  AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA  916

Query 1037  CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA  990

Query 1111  GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTACGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTATGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA  1064

Query 1185  TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC  1138

Query 1259  CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT  1212

Query 1333  TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG  1286

Query 1407  CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC  1360

Query 1481  TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA  1434

Query 1555  ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAG------  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1435  ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAGCAAAGG  1508

Query 1623  -----GTTCAAGATGGCAACAT---------CAGAG-----CAT------------------------------  1647
                 .|||.||.|  ||||||         .||||     |||                              
Sbjct 1509  GTTACCTTCCAGTT--CAACATTTACCTTGGAAGAGGGGACCATCTACTTGACCGCTGAGCCCAACACTCTGGA  1580

Query 1648  ----------------------------------------  1647
                                                    
Sbjct 1581  AGTGCAGGATGACAATGCTTCTGTGCTTGACGTCTATTTA  1620