Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14897
- Subject:
- NM_003618.4
- Aligned Length:
- 2682
- Identities:
- 2617
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATTATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTT------------------------------------------------------ 1056
||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA 1110
Query 1057 ---------GATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT 1121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT 1184
Query 1122 TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG 1258
Query 1196 ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA 1269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA 1332
Query 1270 CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC 1343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC 1406
Query 1344 AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG 1480
Query 1418 GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA 1554
Query 1492 AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA 1565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA 1628
Query 1566 TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC 1639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC 1702
Query 1640 CAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT 1713
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT 1776
Query 1714 GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT 1850
Query 1788 ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT 1861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT 1924
Query 1862 TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC 1935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC 1998
Query 1936 CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC 2009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC 2072
Query 2010 ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT 2083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT 2146
Query 2084 TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT 2157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT 2220
Query 2158 GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG 2231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG 2294
Query 2232 GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT 2305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT 2368
Query 2306 GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC 2379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC 2442
Query 2380 ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA 2516
Query 2454 AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT 2527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT 2590
Query 2528 CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG 2601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG 2664
Query 2602 GGTCATGAAAACAGTTAC 2619
||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GGTCATGAAAACAGTTAC 2682