Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14949
• Subject: NM_133985.2
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1431
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCCGAGGACTCGAGCGCCCTGCCCTGGTCCATCAACAGGGACGATTACGAGCTGCAGGAGGTGATCGGGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCCGAGGACTCGAGCGCCCTGCCCTGGTCCATCAACAGGGACGACTACGAGCTGCAGGAGGTGATAGGGAG  74

Query   75  TGGAGCAACTGCTGTAGTCCAAGCAGCTTATTGTGCCCCTAAAAAGGAGAAAGTGGCAATCAAACGGATAAACC  148
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TGGAGCAACTGCCGTGGTCCAAGCAGCTTACTGTGCCCCCAAAAAGGAGAGAGTGGCGATCAAGCGGATAAACC  148

Query  149  TTGAGAAATGTCAAACTAGCATGGATGAACTCCTGAAAGAAATTCAAGCCATGAGTCAATGCCATCATCCTAAT  222
            |.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  149  TGGAGAAGTGTCAGACCAGCATGGATGAGCTCCTGAAAGAAATCCAGGCCATGAGCCAATGCCATCATCCTAAC  222

Query  223  ATTGTATCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAAGATGAGCTGTGGCTTGTCATGAAGCTGCTAAGTGGAGGTTC  296
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTGTCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAGGATGAGCTGTGGCTCGTCATGAAGCTGCTAAGTGGAGGTTC  296

Query  297  TGTTCTGGATATTATTAAGCACATTGTGGCAAAAGGGGAACACAAAAGTGGAGTCCTAGATGAATCTACCATTG  370
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||..|.|||||||
Sbjct  297  TGTTCTGGATATTATTAAACACATTGTGGCAAAGGGGGAACATAAGAGTGGAGTTCTGGACGAGCCAACCATTG  370

Query  371  CTACGATACTCCGAGAAGTACTGGAAGGGCTGGAATATCTGCATAAAAATGGACAGATCCACAGAGATGTGAAA  444
            ||||.||.|||||||||||..|.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CTACAATCCTCCGAGAAGTCTTAGAAGGACTGGAGTACCTGCATAAGAATGGGCAGATTCACAGAGATGTGAAA  444

Query  445  GCTGGAAACATTCTTCTTGGAGAAGATGGCTCAGTACAGATTGCAGACTTTGGGGTTAGTGCTTTTTTAGCAAC  518
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  GCTGGAAACATTCTTCTAGGAGAAGACGGCTCTGTGCAGATTGCAGATTTCGGCGTCAGTGCTTTTTTAGCCAC  518

Query  519  TGGTGGTGATATTACCCGAAATAAAGTGAGAAAGACCTTTGTTGGCACCCCTTGTTGGATGGCACCTGAAGTTA  592
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TGGTGGTGACATTACCAGAAATAAAGTGAGAAAAACGTTTGTTGGCACCCCGTGCTGGATGGCACCCGAAGTTA  592

Query  593  TGGAACAGGTCCGTGGTTATGATTTCAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATTACAGCAATTGAATTGGCTACA  666
            ||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||.|||
Sbjct  593  TGGAGCAGGTTCGAGGTTATGATTTTAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATCACTGCGATTGAACTGGCCACA  666

Query  667  GGGGCGGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACACTGCAGAACGATCCTCCTTCTTT  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GGGGCAGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACGCTCCAGAATGATCCTCCTTCTTT  740

Query  741  GGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAAAAATATGGAAAATCATTTAGAAAAATGATTTCATTGTGCC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAGAAATATGGAAAATCATTTAGAAAAATGATTTCATTGTGCC  814

Query  815  TTCAAAAAGATCCAGAAAAAAGACCAACAGCAGCAGAACTATTAAGGCACAAATTTTTCCAGAAAGCAAAGAAT  888
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAAAAGGATCCAGAAAAAAGGCCAACAGCAGCAGAACTGTTGAGGCACAAATTTTTCCAGAAAGCAAAGAAT  888

Query  889  AAAGAATTTCTTCAAGAAAAAACATTGCAGAGAGCACCAACCATTTCTGAAAGAGCAAAAAAGGTTCGGAGAGT  962
            ||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||
Sbjct  889  AAAGAATTTCTTCAAGAAAAAATACTCCAGAGAGCACCTACCATTTCTGAAAGATCTAAAAAGGTCCGCAGAGT  962

Query  963  ACCAGGTTCCAGTGGGCGTCTTCATAAGACAGAGGATGGAGGCTGGGAGTGGAGTGATGATGAATTTGATGAAG  1036
            .||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  CCCCGGCTCCAGTGGCCGTCTCCATAAGACAGAGGACGGAGGCTGGGAGTGGAGTGACGATGAGTTTGATGAGG  1036

Query 1037  AAAGTGAGGAAGGGAAAGCAGCAATTTCACAACTCAGGTCTCCCCGAGTGAAAGAATCAATATCAAATTCTGAG  1110
            |.||.||||||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|.|||||||
Sbjct 1037  AGAGCGAGGAAGGGAGAGCTGCCATTTCTCAGCTGAGGTCTCCCCGAGTAAAAGACTCATTATCCAGTTCTGAG  1110

Query 1111  CTCTTTCCAACAACTGATCCTGTGGGTACTTTGCTCCAAGTTCCAGAACAGATCTCTGCTCATCTACCTCAGCC  1184
            |||||..|..||.||||.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCTTCGCGGCAGCTGAGCCCATGGGGACTTTGCTTCAAGTTCCAGAACAGATTTCTGCTCATCTACCTCAGCC  1184

Query 1185  AGCTGGGCAGATTGCTACACAGCCAACTCAAGTCTCTCTCCCACCCACCGCAGAGCCAGCAAAAACAGCTCAGG  1258
            ||||||.|||||..|.|||||||||.|||||||||||||||..|||.|.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1185  AGCTGGCCAGATGCCCACACAGCCAGCTCAAGTCTCTCTCCTGCCCCCTGCAGAGCCAGCAAAACCAGCACAGG  1258

Query 1259  CTTTGTCTTCAGGATCAGGTTCACAAGAAACCAAGATCCCAATCAGTCTAGTACTAAGATTAAGGAATTCCAAA  1332
            ||..||||||||||..|.|.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCAGTCTTCAGGAGAACGGTCCCAGGAGACCAAGATCCCTATCAGTCTAGTGCTAAGATTAAGGAATTCCAAA  1332

Query 1333  AAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAGGGTGTCTCTCAGGAACTCAT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  AAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAGGGTGTTTCTCAGGAGCTCAT  1406

Query 1407  TTCTGCTGGCCTGGTCGACGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCTAATTTGCAGAAAATTGTGGAAGAACCTC  1480
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCTGCTGGCCTGGTTGATGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCCAATCTGCAGAAGATTGTGGAAGAACCTC  1480

Query 1481  AGTCAAATCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTCGAAGGCTCAGATATTCCTGATGATGGTAAACTG  1554
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  AGTCAAACCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTTGAAGGCTCGGATATTCCTGATGATGGCAAACTG  1554

Query 1555  ATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC  1581
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC  1581