Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14984
- Subject:
- NM_001294334.1
- Aligned Length:
- 2326
- Identities:
- 1921
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ---ATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGT 71
|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGATGGAAGAACTGCATAGCCTGGACCCACGAAGGCAGGAATTACTAGAGGCCAGGTTCACTGGAGTTGGTGT 74
Query 72 TAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAG 145
.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGTAAGGGGCCACTCAACAGTGAGTCTTCCAACCAGAGTCTGTGCAGCGTGGGGTCGTTGAGTGATAAAGAAG 148
Query 146 TAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATATGAAACTAGCCAA 219
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TAGAGACTCCTGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGGAAAGCCGAGCCATATGACACTAGCCAA 222
Query 220 GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAG 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 223 GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGGGCCAGGAACCAG 296
Query 294 CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGAG 367
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGTCGAG 370
Query 368 TAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACC 441
.|||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 CAGAACAGCCTCTGTATGGTTTAGATGGCAGTGCAGCAAAGGAGGCCTCAGAAGAGCAGTCTGCTCTGCCCACC 444
Query 442 CTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAGGGGAGCTGGCCTCTGCTT 515
|||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTCATGTCAGTGATGTTAGCAAAACCGCGACTTGACACAGAGCAGTTAGCGCCACGGGGAGCTGGCCTCTGCTT 518
Query 516 CACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCC 589
||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 519 CACTTTCGTCTCTGCTCAACAAAACAGTCCTTCTTCTACGGGTTCTGGCAATACAGAACATTCTTGCAGCTCCC 592
Query 590 AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC 663
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCTGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC 666
Query 664 AGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG 737
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTAAGAACTCTGACTTAGAGAAGAAGGAAGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG 740
Query 738 GCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGA 811
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 741 ACAGATAGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTCACCATGAGCAAGA 814
Query 812 AACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTG 885
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.
Sbjct 815 AGCTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGCAGAGATAAGAGCATGCAGGACCGATTGCGATTA 888
Query 886 GGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGCTTTTCAGAATCT 959
||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 GGCCACTTTACTACTGTCCGGCATGGAGCCTCGTTTACTGAGCAGTGGACAGATGGTTATGCTTTCCAAAACCT 962
Query 960 TATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGA 1033
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 CATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGAGAAGAGATAGAAAGGCAACGGAAAATGTTAGCAAAACGGA 1036
Query 1034 AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAATGGAGCT 1107
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAACGGAAAAGCAAGACTAATGGAGCT 1110
Query 1108 GAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGCCTTAGGAGCCCACAGTTTACT 1181
|||||||||||
Sbjct 1111 GAAAATGAAAC--------------------------------------------------------------- 1121
Query 1182 TAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTAAAAAGGAGG 1255
||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1122 ---GTTAACGTTAGCCGAGTACCATGAACAAGAGGAAATCTTCAAACTTAGATTAGGTCATCTTAAGAAAGAGG 1192
Query 1256 AAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACATATCAGGGAACTAAAAAGGATA 1329
|||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1193 AAGCAGAAATCCAGGCAGAGCTGGAAAGGCTGGAAAGGGTTAGGAATCTACACATCAGGGAATTAAAAAGGATA 1266
Query 1330 CATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATCTTTTGGG 1403
|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 CATAATGAAGACAATTCGCAGTTTAAAGACCATCCAACACTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATCTTTTGGG 1340
Query 1404 TAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGATACGTAGCTGTGAAAATTCACC 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1341 TAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACGGAGCAAAGATATGTAGCTGTGAAAATTCACC 1414
Query 1478 AGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACCGGATTCAT 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1415 AGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCGTGTAGGGAATACCGGATTCAC 1488
Query 1552 AAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGATACTGACTCGTTTTGTACAGT 1625
||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 AAGGAGCTGGACCACCCCAGGATAGTGAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGACACTGACTCGTTTTGTACAGT 1562
Query 1626 ATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAAAGAGGCCC 1699
|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1563 ATTAGAATACTGTGAAGGGAATGACCTGGACTTCTACCTAAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAAAGAAGCCC 1636
Query 1700 GGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATACACTATGAC 1773
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 GATCCATTATTATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATACACTATGAC 1710
Query 1774 CTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTTC 1847
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CTCAAACCAGGTAATATCCTTTTAGTAAATGGTACAGCATGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTTC 1784
Query 1848 GAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACATCACAAGGTGCTGGTACTTATT 1921
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1785 CAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTGACGTCACAAGGAGCTGGTACTTATT 1858
Query 1922 GGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATGTGTGGTCG 1995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1859 GGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAGCCACCAAAGATCTCAAATAAAGTCGATGTTTGGTCA 1932
Query 1996 GTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAACCAGTCTCAGCAAGACATCCT 2069
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||| .|.||.|||
Sbjct 1933 GTGGGTGTGATCTTCTACCAGTGTCTTTATGGGAGGAAG-------------------GTGAGGAAG------- 1980
Query 2070 ACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCC----GCCAAAGCCAGTAGTAACACCTGAAGCA 2139
||| |.||||.||...|| ||||.|.|| |.||||| ||
Sbjct 1981 --AAG-----------------------GCAGTGGAGCAGCCTGGGGCCATACCC------ACCACCT----CA 2019
Query 2140 AAGGCGTTTATTC------GACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAGCAGCTGGCCTG 2207
..|| |.||.||| |...||..||||..|.|.|||||.|| ||.|.|..||.|
Sbjct 2020 CTGG-GATTCTTCTTTGCAGTTAATCATTGGAATCCTGAAAGTAG--------TGGTTTAAAGAA--------- 2075
Query 2208 TGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTATTGCATCAA 2281
.||.|..|||| ||||.
Sbjct 2076 -AATACAGACTT-----CTCAG---------------------------------------------------- 2091
Query 2282 CCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT 2313
Sbjct 2092 -------------------------------- 2091