Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14996
• Subject: NM_001371577.1
• Aligned Length: 2041
• Identities: 1403
• Gaps: 637

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCATACAATAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |
Sbjct 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGC---------A  1397

Query 1407  ACTTAGTATGAAACTTT---------------------------------------------------------  1423
            |||          |||.                                                         
Sbjct 1398  ACT----------CTTCCTCAAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGCACAGCAGCAGCCGGCAGGC  1461

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1462  ACGTTTTACCAGCAGCAGCAGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGAAACCAGCAAT  1535

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1536  TGCTCAGTTCCCTGTGGTGTCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGCAGCAGCAGC  1609

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1610  AGCAGCAACAACAACAGCAACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACTCAGCAGGCT  1683

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1684  GCCTTGCAGCAAAAGCCCACTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCCACAGCCAGC  1757

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1758  CCCTGCCCAGGAGCCAGCGATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCACCTCCTGCCG  1831

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1832  TCCAGGGGCAGAAAGTTGGATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGGCGTATT  1905

Query 1424  --------------------------------------------------------------------------  1423
                                                                                      
Sbjct 1906  CTCAGTGACGTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGC  1979

Query 1424  -------------------------------------------  1423
                                                       
Sbjct 1980  AGCTGAGGCAGAATTGCTTGACCCAGGGAGGCAGACTTTGCAG  2022