Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15039
• Subject: XM_006506219.3
• Aligned Length: 730
• Identities: 576
• Gaps: 74

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||                                       
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAACCCCTGCT---------------------------------------  35

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
                        |.|||    ||                |||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  36  -------------ACCTA----CG----------------GCTCTCTTAAGAGCCTGTGCTGATGGGGGTGCCA  76

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           |||.||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||.||||||||||||
Sbjct  77  ACCACTTATATGATCTCACTGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTCTTGCCTGAATTCGTCAGTGGGGACTTTGATTCT  150

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACAC  296
           ||||||||||||||||.|||.|||||..|.|..|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 151  ATTAGGCCTGAAGTCAAAGAGTACTACACCAAGAAGGGCTGTGATCTTATTTCAACTCCTGACCAAGACCACAC  224

Query 297  TGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGA  370
           |||||||||.|||||.|||.||.|||||||||.|||||||||.|||||.||..|..|||||||.|||||.||||
Sbjct 225  TGACTTTACCAAGTGTCTTCAAGTGCTCCAAAGGAAGATAGAGGAAAAGGAACTGCAGGTTGACGTGATTGTGA  298

Query 371  CACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATC  444
           ||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||
Sbjct 299  CACTGGGAGGTCTCGGTGGGCGTTTTGACCAAATCATGGCCTCTGTGAATACCCTTTTCCAAGCCACTCACATC  372

Query 445  ACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCA  518
           ||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||
Sbjct 373  ACTCCTGTGCCGATTATAATAATCCAAAAGGACTCTCTCATCTACCTCCTCCAACCCGGGAAGCACAGGCTCCA  446

Query 519  TGTAGACACTGGAATGGAGGGTGA-TTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAACC  591
           ||||||||||||||||||.|| || .|||||||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.||.||.
Sbjct 447  TGTAGACACTGGAATGGAAGG-GAGCTGGTGTGGCCTGATTCCTGTTGGACAGCCTTGCAACCAGGTGACGACA  519

Query 592  ACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACGA  665
           ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||..|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 520  ACAGGCCTGAAATGGAACCTCACAAATGATGTTCTTGGCTTTGGAACACTGGTCAGTACTTCTAACACCTACGA  593

Query 666  CGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
           .|||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 594  TGGGTCCGGCCTTGTCACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAGAGC  657