Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15039
• Subject: XM_011516040.2
• Aligned Length: 807
• Identities: 640
• Gaps: 159

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACT-----------------------------------------  255
           |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGA  296

Query 256  -------------------------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  292
                                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAGAAGGAACCTTTCTCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  370

Query 293  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC  444

Query 367  GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA  518

Query 441  CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT  514
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT  592

Query 515  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACA  588
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 593  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACA  666

Query 589  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTA  662
           |||||||||||||||||||||||||                           |..|||.||.||||||      
Sbjct 667  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCA---------------------------TTCTCATTATTTCCAA------  707

Query 663  CGACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
               |||                           ||||||   .|||.|||             || 
Sbjct 708  ----GGG---------------------------CACCCA---ATCTAGAC-------------AG-  726