Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15065
- Subject:
- NM_001346487.2
- Aligned Length:
- 2721
- Identities:
- 2694
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
Query 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG 148
Query 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
Query 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
Query 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
Query 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
Query 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
Query 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
Query 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
Query 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
Query 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
Query 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 888
Query 889 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 962
Query 963 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 1036
Query 1037 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 1110
Query 1111 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 1184
Query 1185 GCATAAGAAA---------------------------GATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG 1231
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCATAAGAAAGTAGGTTTCTTGGTACCCTCCACAGAGGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG 1258
Query 1232 ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT 1332
Query 1306 GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA 1406
Query 1380 GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG 1480
Query 1454 AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG 1554
Query 1528 AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA 1628
Query 1602 GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT 1702
Query 1676 GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC 1776
Query 1750 AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA 1850
Query 1824 CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG 1924
Query 1898 AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA 1998
Query 1972 GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA 2072
Query 2046 ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC 2119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC 2146
Query 2120 AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC 2220
Query 2194 AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC 2294
Query 2268 ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG 2368
Query 2342 CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA 2442
Query 2416 ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA 2516
Query 2490 GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA 2590
Query 2564 AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC 2637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC 2664
Query 2638 CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2694
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2721