Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15065
- Subject:
- XM_017019412.2
- Aligned Length:
- 2721
- Identities:
- 2184
- Gaps:
- 537
Alignment
Query 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCTTC 8
Query 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 82
Query 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 156
Query 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 230
Query 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 304
Query 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 378
Query 889 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 452
Query 963 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 526
Query 1037 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 600
Query 1111 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 674
Query 1185 GCATAAGAAA---------------------------GATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG 1231
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GCATAAGAAAGTAGGTTTCTTGGTACCCTCCACAGAGGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG 748
Query 1232 ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT 822
Query 1306 GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA 896
Query 1380 GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG 970
Query 1454 AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG 1044
Query 1528 AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA 1118
Query 1602 GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT 1192
Query 1676 GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC 1266
Query 1750 AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA 1340
Query 1824 CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG 1414
Query 1898 AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA 1488
Query 1972 GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA 1562
Query 2046 ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC 2119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC 1636
Query 2120 AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC 1710
Query 2194 AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC 1784
Query 2268 ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG 1858
Query 2342 CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA 1932
Query 2416 ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA 2006
Query 2490 GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007 GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA 2080
Query 2564 AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC 2637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC 2154
Query 2638 CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2694
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2211