Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15065
• Subject: XM_017019413.2
• Aligned Length: 2694
• Identities: 2184
• Gaps: 510

Alignment

Query    1  ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC  518
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCTTC  8

Query  519  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    9  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  82

Query  593  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   83  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  156

Query  667  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  230

Query  741  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  304

Query  815  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  378

Query  889  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  452

Query  963  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  526

Query 1037  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  600

Query 1111  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  674

Query 1185  GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC  748

Query 1259  AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT  822

Query 1333  ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG  896

Query 1407  CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC  970

Query 1481  AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC  1044

Query 1555  ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA  1118

Query 1629  AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA  1192

Query 1703  ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA  1266

Query 1777  CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG  1340

Query 1851  GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA  1414

Query 1925  AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG  1488

Query 1999  TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA  1562

Query 2073  GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG  1636

Query 2147  AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637  AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC  1710

Query 2221  CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711  CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT  1784

Query 2295  TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG  1858

Query 2369  CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC  1932

Query 2443  AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG  2006

Query 2517  AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC  2080

Query 2591  TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT  2154

Query 2665  ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2694
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2184