Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15079
• Subject: XM_017313273.1
• Aligned Length: 1325
• Identities: 820
• Gaps: 436

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query    1  -------------------------------------------------ATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  25
                                                             |||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA  370

Query   26  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  99
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  371  GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG  444

Query  100  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  173
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG  518

Query  174  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  247
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct  519  CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG  592

Query  248  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  321
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA  666

Query  322  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  395
            |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG  740

Query  396  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  469
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA  814

Query  470  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  543
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  815  ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA  888

Query  544  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC  962

Query  618  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCAC---GTAGATTCTG  688
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||..||      ||||..|.|   |.|||     
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTACTACATCA------TCAGAGCGCCGAGGAGA-----  1025

Query  689  GTG------------CATCTG------CAATAACTCGAGA----AAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACA  740
            |||            ||.|.|      |||||.||| |.|    |.|.|.|||         |.||||      
Sbjct 1026  GTGGGAAATCCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTC-ATACCTGACGTCTCAC---------TTGGCC------  1083

Query  741  ACAGCAG-CCTC--------TTCGAAAT-CAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCC  804
               |||| ||.|        |||  |.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1084  ---GCAGACCGCCATGGGGGTTC--AGTACAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACCCC  1152

Query  805  ACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA---------  869
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1153  ACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTGAA  1226

Query  870  ---------------GTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGCCACAAG  921
                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1227  AATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG  1293