Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15089
• Subject: XM_005244806.3
• Aligned Length: 1761
• Identities: 1689
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGACGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74
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Sbjct    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74

Query   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGCTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148
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Sbjct   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148

Query  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC  222
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Sbjct  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC  222

Query  223  CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296

Query  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370
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Sbjct  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370

Query  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444
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Sbjct  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444

Query  445  CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518
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Sbjct  445  CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518

Query  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592
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Sbjct  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592

Query  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666
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Sbjct  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666

Query  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT  740
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Sbjct  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGT  740

Query  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCAC-GCTTGTCGCC  813
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Sbjct  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGC-CGTCACT  813

Query  814  GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGC  887
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Sbjct  814  GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGC  887

Query  888  GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCA  961
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Sbjct  888  GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTA  961

Query  962  GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTAC  1035
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Sbjct  962  GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTAC  1035

Query 1036  AGGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG  1109
            |||.||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG  1109

Query 1110  CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC  1183
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Sbjct 1110  CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC  1183

Query 1184  TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAG  1257
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Sbjct 1184  TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAG  1257

Query 1258  CGAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAG  1331
            ||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||
Sbjct 1258  CGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAG  1331

Query 1332  CAACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATG  1405
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Sbjct 1332  CAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACG  1405

Query 1406  AGATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTT  1479
            .|||||||||||||||||||||...|||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||.|.||||
Sbjct 1406  TGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTT  1479

Query 1480  CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT  1553
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Sbjct 1480  CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT  1553

Query 1554  CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATG  1627
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Sbjct 1554  CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATG  1627

Query 1628  CCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAG  1701
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Sbjct 1628  CCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAG  1701

Query 1702  AAGATGTGCTGGCTGA--AGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC  1758
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Sbjct 1702  ATGATGCGCTGGCTGAAGAGGGGGA--GGCCTGGGCCCGAGGACGAGCAACCCTCATCC  1758