Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15089
- Subject:
- XM_024448098.1
- Aligned Length:
- 1836
- Identities:
- 1756
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGACGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
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Sbjct 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
Query 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGCTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
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Sbjct 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGGTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
Query 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC 222
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Sbjct 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC 222
Query 223 CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC 296
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Sbjct 223 CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC 296
Query 297 CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC 370
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Sbjct 297 CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC 370
Query 371 GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG 444
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Sbjct 371 GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG 444
Query 445 CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC 518
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Sbjct 445 CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC 518
Query 519 CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA 592
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Sbjct 519 CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA 592
Query 593 AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC 666
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Sbjct 593 AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC 666
Query 667 TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT 740
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Sbjct 667 TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT 740
Query 741 GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCACGCTTGTCGCCG 814
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Sbjct 741 GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCACGCTTGTCGCCG 814
Query 815 GCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGCG 888
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Sbjct 815 GCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGCG 888
Query 889 CTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCAG 962
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Sbjct 889 CTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCAG 962
Query 963 TCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTACA 1036
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Sbjct 963 TCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTACA 1036
Query 1037 GGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGC 1110
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Sbjct 1037 GGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGC 1110
Query 1111 ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCT 1184
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Sbjct 1111 ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCT 1184
Query 1185 CTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAGC 1258
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Sbjct 1185 CTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAGC 1258
Query 1259 GAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAGC 1332
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Sbjct 1259 GAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAGC 1332
Query 1333 AACAA--------------------------------------------------------------------- 1337
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Sbjct 1333 AACAACCCCAGTCACGTGTCACACGGAGGATCAAGTCCTGCTGGTCGGCCGTGGCTGACTCCTCAGGCACGTTG 1406
Query 1338 ---------GTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCA 1402
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Sbjct 1407 GGCTCCCAGGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCA 1480
Query 1403 ATGAGATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTAT 1476
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Sbjct 1481 ATGAGATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTAT 1554
Query 1477 GTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGA 1550
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Sbjct 1555 GTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGA 1628
Query 1551 GGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGT 1624
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Sbjct 1629 GGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGT 1702
Query 1625 ATGCCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAG 1698
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Sbjct 1703 ATGCCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAG 1776
Query 1699 CAGAAGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC 1758
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Sbjct 1777 CAGAAGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC 1836