Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15118
- Subject:
- XM_006717483.4
- Aligned Length:
- 1159
- Identities:
- 1060
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT 74
Query 75 CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG 148
Query 149 CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA 222
Query 223 AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA 296
Query 297 GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC 370
Query 371 TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA 444
Query 445 AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG 518
Query 519 CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT 592
Query 593 ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT 666
Query 667 GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA 740
Query 741 CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC 814
Query 815 AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG 888
Query 889 ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTCAGACATATGAGAAA 962
Query 963 ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG 1036
Query 1037 ACT----GTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCGA 1106
||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACTGTGCGTCTGGCACCTTCCACGCTCTG--------------------------------------------- 1065
Query 1107 GCGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG 1155
Sbjct 1066 ------------------------------------------------- 1065