Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15129
• Subject: NM_001172685.1
• Aligned Length: 1113
• Identities: 1011
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATG-ATC-TCAGATCCCCCCTCAAACAA-------CAGCTGGAACTCTGTTCTCTATCTTCTAGAGGACCGAAA  65
            ||| ||| ||.||||          |||       ||||||..|.|..|..|     |....||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATCGTCCGATC----------CAAGTGAAGCCAGCTGCCAGTGAGGGC-----CGAGGAGAGGACCGAAA  59

Query   66  GCTGTTTGTGGGGATGCTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGACGTCAGACGCCTGTTCCAGCCCTTTGGCCACA  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   60  GCTGTTTGTGGGGATGCTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGACGTCAGACGCCTGTTCCAGCCCTTTGGCCACA  133

Query  140  TCGAGGAGTGCACGGTCCTGCGGAGTCCTGACGGCACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCGGGAGTCAA  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  TCGAGGAGTGCACGGTCCTGCGGAGTCCTGACGGCACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCGGGAGTCAA  207

Query  214  GGGGAAGCTCAGGCGGCCATCCGGGGTCTGCACGGCAGCCGGACCATGGCGGGCGCCTCGTCCAGCCTCGTGGT  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  GGGGAAGCTCAGGCGGCCATCCGGGGTCTGCACGGCAGCCGGACCATGGCGGGCGCCTCGTCCAGCCTCGTGGT  281

Query  288  CAAGCTGGCGGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGGCGGATGCAGCAGATGGCCGGCCACCTGGGCGCCTTCC  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  CAAGCTGGCGGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGGCGGATGCAGCAGATGGCCGGCCACCTGGGCGCCTTCC  355

Query  362  ACCCCGCGCCACTGCCGCTAGGGGCCTGCGGCGCCTACACCACGGCGATCCTGCAGCACCAGGCGGCCCTGCTG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  ACCCCGCGCCACTGCCGCTAGGGGCCTGCGGCGCCTACACCACGGCGATCCTGCAGCACCAGGCGGCCCTGCTG  429

Query  436  GCGGCGGCACAGGGCCCAGGCCTAGGCCCGGTGGCGGCAGTGGCGGCCCAGATGCAACACGTGGCGGCCTTTAG  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  GCGGCGGCACAGGGCCCAGGCCTAGGCCCGGTGGCGGCAGTGGCGGCCCAGATGCAACACGTGGCGGCCTTTAG  503

Query  510  CCTGGTAGCTGCGCCTCTGTTGCCCGCGGCAGCAGCCAACTCCCCGCCTGGCAGCGGCCCTGGCACCCTCCCAG  583
            ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CCTGGTAGCTGCGCCTCTGTTGCCCGCG---GCAGCCAACTCCCCGCCTGGCAGCGGCCCTGGCACCCTCCCAG  574

Query  584  GTCTTCCGGCGCCCATCGGGGTCAATGGATTCGGCCCTCTGACCCCCCAGACCAATGGCCAGCCGGGCTCCGAC  657
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Sbjct  575  GTCTTCCGGCGCCCATCGGGGTCAATGGATTCGGCCCTCTGACCCCCCAGACCAATGGCCAGCCGGGCTCCGAC  648

Query  658  ACGCTCTACAATAACGGGCTCTCCCCTTATCCAGCCCAGAGCCCCGGCGTGGCTGACCCCCTGCAGCAGGCCTA  731
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  649  ACGCTCTACAATAACGGGCTCTCCCCTTATC-------------------------------------------  679

Query  732  CGCTGGGATGCACCACTACGCAGCAGCCTATCCGTCGGCCTATGCCCCAGTGAGCACAGCTTTTCCCCAGCAGC  805
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  --------------------CAGCAGCCTATCCGTCGGCCTATGCCCCAGTGAGCACAGCTTTTCCCCAGCAGC  733

Query  806  CTTCAGCCCTGCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACCTGCCTCAGGAG  879
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Sbjct  734  CTTCAGCCCTGCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACCTGCCTCAGGAG  807

Query  880  TTTGGTGATGCGGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTTGGAGCCGTTGTCTCTGCTAAAGTCTTTGTGGATCG  953
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Sbjct  808  TTTGGTGATGCGGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTTGGAGCCGTTGTCTCTGCTAAAGTCTTTGTGGATCG  881

Query  954  AGCCACCAACCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACTAGTGCCCAGACTGCTATTCAGG  1027
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Sbjct  882  AGCCACCAACCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACTAGTGCCCAGACTGCTATTCAGG  955

Query 1028  CGATGAATGGCTTTCAAATTGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGCGGCCCAAGGATGCCAACCGGCCT  1101
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Sbjct  956  CGATGAATGGCTTTCAAATTGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGCGGCCCAAGGATGCCAACCGGCCT  1029

Query 1102  TAC  1104
            |||
Sbjct 1030  TAC  1032