Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15166
- Subject:
- NM_001253884.1
- Aligned Length:
- 1250
- Identities:
- 958
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 MNNQKVVAVLLQECKQVLDQLLLEAPDVSEEDKSEDQRCRALLPSELRTLIQEAKEMKWPFVPEKWQYKQAVGP 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 EDKTNLKDVIGAGLQQLLASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV 148
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Sbjct 1 ----MCRKRTRARTSAAEASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV 70
Query 149 IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV 222
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Sbjct 71 IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV 144
Query 223 GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV 296
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Sbjct 145 GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV 218
Query 297 LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG 370
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Sbjct 219 LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG 292
Query 371 ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL 444
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Sbjct 293 ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL 366
Query 445 ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI 518
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Sbjct 367 ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI 440
Query 519 SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS 592
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Sbjct 441 SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS 514
Query 593 ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ 666
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Sbjct 515 ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ 588
Query 667 QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK 740
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Sbjct 589 QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK 662
Query 741 EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS 814
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Sbjct 663 EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS 736
Query 815 MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP 888
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Sbjct 737 MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP 810
Query 889 NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP 962
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Sbjct 811 NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP 884
Query 963 GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD 1036
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Sbjct 885 GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD 958
Query 1037 YLTVKKKADKEMLFGFIIFIKKKFWGGMLGKTIRSRRGSGTTSLMWSDR------------------------- 1085
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Sbjct 959 YLTVKKKGRQRNAFWVHHLHQEEILGRYVGKDYKEQKG------LWHHFTDVERQMTAQHYVTEFNKRLYEQNI 1026
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1027 PTQIFYIPSTILLILEDKTIKGCISVEPYILGEFVKLSNNTKVVKTEYKATEYGLAYGHFSYEFSNHRDVVVDL 1100
Query 1086 ------------------------------------------------------------------ 1085
Sbjct 1101 QGWVTGNGKGLIYLTDPQIHSVDQKVFTTNFGKRGIFYFFNNQHVECNEICHRLSLTRPSMEKPCT 1166