Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15166
• Subject: NM_025144.4
• Aligned Length: 1250
• Identities: 1049
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  MNNQKVVAVLLQECKQVLDQLLLEAPDVSEEDKSEDQRCRALLPSELRTLIQEAKEMKWPFVPEKWQYKQAVGP  74
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Sbjct    1  MNNQKVVAVLLQECKQVLDQLLLEAPDVSEEDKSEDQRCRALLPSELRTLIQEAKEMKWPFVPEKWQYKQAVGP  74

Query   75  EDKTNLKDVIGAGLQQLLASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV  148
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Sbjct   75  EDKTNLKDVIGAGLQQLLASLRASILARDCAAAAAIVFLVDRFLYGLDVSGKLLQVAKGLHKLQPATPIAPQVV  148

Query  149  IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV  222
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Sbjct  149  IRQARISVNSGKLLKAEYILSSLISNNGATGTWLYRNESDKVLVQSVCIQIRGQILQKLGMWYEAAELIWASIV  222

Query  223  GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV  296
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Sbjct  223  GYLALPQPDKKGLSTSLGILADIFVSMSKNDYEKFKNNPQINLSLLKEFDHHLLSAAEACKLAAAFSAYTPLFV  296

Query  297  LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG  370
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Sbjct  297  LTAVNIRGTCLLSYSSSNDCPPELKNLHLCEAKEAFEIGLLTKRDDEPVTGKQELHSFVKAAFGLTTVHRRLHG  370

Query  371  ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL  444
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Sbjct  371  ETGTVHAASQLCKEAMGKLYNFSTSSRSQDREALSQEVMSVIAQVKEHLQVQSFSNVDDRSYVPESFECRLDKL  444

Query  445  ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI  518
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Sbjct  445  ILHGQGDFQKILDTYSQHHTSVCEVFESDCGNNKNEQKDAKTGVCITALKTEIKNIDTVSTTQEKPHCQRDTGI  518

Query  519  SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS  592
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Sbjct  519  SSSLMGKNVQRELRRGGRRNWTHSDAFRVSLDQDVETETEPSDYSNGEGAVFNKSLSGSQTSSAWSNLSGFSSS  592

Query  593  ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ  666
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Sbjct  593  ASWEEVNYHVDDRSARKEPGKEHLVDTQCSTALSEELENDREGRAMHSLHSQLHDLSLQEPNNDNLEPSQNQPQ  666

Query  667  QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK  740
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Sbjct  667  QQMPLTPFSPHNTPGIFLAPGAGLLEGAPEGIQEVRNMGPRNTSAHSRPSYRSASWSSDSGRPKNMGTHPSVQK  740

Query  741  EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS  814
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Sbjct  741  EEAFEIIVEFPETNCDVKDRQGKEQGEEISERGAGPTFKASPSWVDPEGETAESTEDAPLDFHRVLHNSLGNIS  814

Query  815  MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP  888
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Sbjct  815  MLPCSSFTPNWPVQNPDSRKSGGPVAEQGIDPDASTVDEEGQLLDSMDVPCTNGHGSHRLCILRQPPGQRAETP  888

Query  889  NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP  962
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Sbjct  889  NSSVSGNILFPVLSEDCTTTEEGNQPGNMLNCSQNSSSSSVWWLKSPAFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSWVSLP  962

Query  963  GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD  1036
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Sbjct  963  GKMRKEILEARTLQPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAHSALLLKYSKKSELWTAQETIVYLGD  1036

Query 1037  YLTVKKKADKEMLFGFIIFIKKKFWGGMLGKTIRSRRGSGTTSLMWSDR-------------------------  1085
            |||||||......|...........|...||......|      .|...                         
Sbjct 1037  YLTVKKKGRQRNAFWVHHLHQEEILGRYVGKDYKEQKG------LWHHFTDVERQMTAQHYVTEFNKRLYEQNI  1104

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1105  PTQIFYIPSTILLILEDKTIKGCISVEPYILGEFVKLSNNTKVVKTEYKATEYGLAYGHFSYEFSNHRDVVVDL  1178

Query 1086  ------------------------------------------------------------------  1085
                                                                              
Sbjct 1179  QGWVTGNGKGLIYLTDPQIHSVDQKVFTTNFGKRGIFYFFNNQHVECNEICHRLSLTRPSMEKPCT  1244