Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15242
- Subject:
- NM_001111030.1
- Aligned Length:
- 1479
- Identities:
- 1270
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGG 74
|||||||..||||.|.||||.||.||..|||.|||.|||||||||.|.||...|||||||||.||..||.||||
Sbjct 1 ATGACCCCAGCGCGCGGCTCCGCACTGAGCCTGGCCCTCCTGCTGGTGGCCCTGGCCGCCGACCTTGCGGCAGG 74
Query 75 ACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAG 148
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 75 ACTGAAGTGTGTGTGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTCACCTGCCAAACGGAAGGAGCATGTTGGGCCTCCG 148
Query 149 TCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTC 222
|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 149 TCATGCTAACCAACGGGAAAGAGCAGGTGATCAAATCGTGTGTGTCCCTCCCGGAACTAAATGCTCAGGTCTTC 222
Query 223 TGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCT 296
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 TGTCACAGTTCCAACAACGTGACCAAAACCGAATGTTGCTTCACAGACTTCTGCAACAATATCACACTGCACCT 296
Query 297 TCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCC 370
|||.||||||||.|||||||||||...||||||.||||..||||||.|..|..||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 297 TCCCACAGCATCGCCAAATGCCCCTCGACTTGGTCCCACAGAGCTGACGGTTGTTATCACCGTGCCGGTTTGCC 370
Query 371 TCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGA 444
|||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||.|||||||..||.||||||.|.||||||||||..||||||
Sbjct 371 TCCTGTCCATAGCCGCCATGCTAACAATATGGGCGTGCCAGGACCGCCAGTGCACATACAGGAAGACTAAGAGA 444
Query 445 CCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGA 518
|..||.|||||||||.|.||..||||||.||..||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 445 CACAACGTGGAGGAAGCGCTGGCTGAGTACAGCCTTGTGAATGCAGGAAAAACACTCAAGGATCTGATCTACGA 518
Query 519 TGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTC 592
||..||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 TGCTACTGCCTCTGGCTCAGGCTCTGGTCTGCCTCTCTTGGTTCAAAGAACAATCGCAAGGACAATTGTACTTC 592
Query 593 AGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAA 666
|.|||||.||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAAATCGTAGGAAAAGGTCGGTTTGGGGAAGTGTGGCACGGAAGATGGTGTGGAGAAGATGTGGCTGTGAAA 666
Query 667 ATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATATTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGA 740
||||||||||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct 667 ATATTCTCCTCCAGGGATGAGAGATCTTGGTTCCGTGAGGCGGAAATTTATCAGACGGTGATGCTGAGACACGA 740
Query 741 AAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT 814
.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 741 GAACATCCTCGGTTTCATCGCAGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACACAACTCTGGCTTGTGTCAGAGT 814
Query 815 ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCATGGCTGGAATGATCAAGCTGGCG 888
||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 815 ATCACGAGCAGGGCTCCTTGTATGACTATTTGAACAGAAACATAGTGACTGTGGCTGGAATGGTCAAGCTGGCG 888
Query 889 CTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCA 962
||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 CTTTCCATAGCGAGTGGTCTGGCTCACCTGCACATGGAGATCGTGGGTACTCAAGGTAAGCCTGCTATTGCTCA 962
Query 963 TCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTAAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTG 1036
.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 963 CCGAGATATAAAGTCAAAGAATATCCTAGTCAAAAAATGTGACACTTGTGCCATAGCTGACTTAGGGCTGGCTG 1036
Query 1037 TGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCT 1110
|||||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 TGAAGCACGATTCTATCATGAACACTATAGACATACCCCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTACATGGCT 1110
Query 1111 CCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGG 1184
||.|||||||||||||||||||||||..|||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 CCCGAAATGCTTGATGATACAATGAACCTGAGCATCTTTGAGTCCTTCAAGCGAGCTGACATCTATTCGGTGGG 1184
Query 1185 TCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATG 1258
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185 GCTGGTTTACTGGGAAATAGCTCGAAGGTGTTCAGTTGGAGGAGTTGTTGAGGAGTACCAGTTGCCTTACTATG 1258
Query 1259 ACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATC 1332
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||.|.||
Sbjct 1259 ACATGGTGCCTTCAGATCCTTCGATAGAAGAAATGAGGAAGGTTGTCTGTGATCAGAAACTCCGACCAAATCTC 1332
Query 1333 CCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGG 1406
|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 CCAAACCAGTGGCAAAGCTGTGAAGCGCTGCGGGTCATGGGAAGAATAATGCGTGAGTGCTGGTACGCCAACGG 1406
Query 1407 AGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC 1479
.||.||.|||||.||.||.||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1407 GGCAGCACGCCTGACAGCCCTGCGCGTGAAGAAGACCATCTCCCAGCTGTGTGTCAAGGAAGACTGTAAAGCT 1479