Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15287
• Subject: NM_001301306.1
• Aligned Length: 1210
• Identities: 742
• Gaps: 439

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVSGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQASSSHQVANFNLPAYDQGL  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  LLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATATFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVESNGSVQIIEEHPPLMLQ  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  NRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILK  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  NHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKYIRPIL  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  QQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFC  370

Query    1  ------------------------MVLMFQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKTPEE  50
                                    .....|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  EAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKTPEE  444

Query   51  HELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFV  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  HELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFV  518

Query  125  TMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASS  198
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TMSHLLDFPHSSHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASS  592

Query  199  STAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQICTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQAT  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  STAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQICTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQAT  666

Query  273  TKHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQGSCTPLMVATLHPQVATITPQYAVPFTLSCAAGRPALVE  346
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  667  TKHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQ---------------------------------------  701

Query  347  QTAAVLQAWPGGTQQILLPSTWQQLPGVALHNSVQPTAMIPEAMGSGQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLT  420
                  ||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  ------QAWPGGTQQILLPSAWQQLPGVALHNSVQPAAVIPEAMGSSQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLT  769

Query  421  NHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLDVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  NHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLEVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD  843

Query  495  QHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEEDNKYKPSSSGLKPRSNVISYVTVNDSPDSDSSLSSPYSTDTLSALR  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  844  QHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEEDNKYKPNSSSLKARSNVISYVTVNDSPDSDSSLSSPHPTDTLSALR  917

Query  569  GNSGSVLEGPGRVVADGTGTRTIIVPPLKTQLGDCTVATQASGLLSNKTKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRG  642
            ||||..||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  GNSGTLLEGPGRPAADGIGTRTIIVPPLKTQLGDCTVATQASGLLSSKTKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRG  991

Query  643  GTSAAQPLNLSQNQQSSVAPTSQERSSNPAPRRQQAFVAPLSQAPYTFQHGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQAH  716
            |.||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  992  GASAVQPLNLSQNQQSSSASTSQERSSNPAPRRQQAFVAPLSQAPYAFQHGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQPH  1065

Query  717  LYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSRHAAAYTTHPSTLVHQVPVSVGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSY  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  LYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSRHAAAYTTHPSTLVHQVPVSVGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSY  1139

Query  791  IGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL  816
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140  IGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL  1165