Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15293
• Subject: XM_011539565.3
• Aligned Length: 1257
• Identities: 1248
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGCAACAGAGCCACCATCCCCCCTCCGGGTCGAGGCGCCGGGCCCCCCAGAAATGCGGACCTCACCGGCGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAACAGAGCCACCATCCCCCCTCCGGGTCGAGGCGCCGGGCCCCCCAGAAATGCGGACCTCACCGGCGAT  74

Query   75  CGAGTCCACCCCTGAGGGCACCCCGCAGCCGGCGGGCGGCAGACTCCGCTTCCTCAACGGCTGCGTGCCCCTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGTCCACCCCTGAGGGCACCCCGCAGCCGGCGGGCGGCAGACTCCGCTTCCTCAACGGCTGCGTGCCCCTCT  148

Query  149  CGCATCAGGTGGCCGGGCACATGTACGGGAAGGACAAAGTGGGTATACTGCAACATCCAGATGGCACAGTTTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCATCAGGTGGCCGGGCACATGTACGGGAAGGACAAAGTGGGTATACTGCAACATCCAGATGGCACAGTTTTG  222

Query  223  AAACAGTTACAACCACCTCCAAGGGGCCCAAGAGAGCTGGAATTCTATAATAT---------GGTTTATGCTGC  287
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||
Sbjct  223  AAACAGTTACAACCACCTCCAAGGGGCCCAAGAGAGCTGGAATTCTATAATATGGTAAGTGAGGTTTATGCTGC  296

Query  288  TGACTGTTTTGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCA  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACTGTTTTGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCA  370

Query  362  CTGCACCAAACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTA  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCACCAAACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTA  444

Query  436  AAGATAGGGCAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATT  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGATAGGGCAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATT  518

Query  510  AATGGAAGAGATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAA  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGGAAGAGATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAA  592

Query  584  ACCAGCATTACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTAC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCAGCATTACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTAC  666

Query  658  TGCTTAAGAAAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAA  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCTTAAGAAAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAA  740

Query  732  GCAGCTTAATTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCTTAATTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGA  814

Query  806  ATGACAGAACTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAAT  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGACAGAACTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAAT  888

Query  880  AACTTTCATGTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTTTCATGTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTA  962

Query  954  TGCGCGTCACAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAG  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCGCGTCACAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAG  1036

Query 1028  ACAATGGGTGGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTAC  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAATGGGTGGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTAC  1110

Query 1102  CATCTTCCCACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAG  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATCTTCCCACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAG  1184

Query 1176  CAACACAATAGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT  1248
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACACAATAGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT  1257