Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15293
• Subject: XM_017016013.2
• Aligned Length: 1248
• Identities: 979
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  ATGGCAACAGAGCCACCATCCCCCCTCCGGGTCGAGGCGCCGGGCCCCCCAGAAATGCGGACCTCACCGGCGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGAGTCCACCCCTGAGGGCACCCCGCAGCCGGCGGGCGGCAGACTCCGCTTCCTCAACGGCTGCGTGCCCCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCATCAGGTGGCCGGGCACATGTACGGGAAGGACAAAGTGGGTATACTGCAACATCCAGATGGCACAGTTTTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAACAGTTACAACCACCTCCAAGGGGCCCAAGAGAGCTGGAATTCTATAATATGGTTTATGCTGCTGACTGTTT  296
                                                     ||..|| |.|..|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGGTA-AGTGAGGTTTATGCTGCTGACTGTTT  32

Query  297  TGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCACTGCACCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  TGATGGTGTTCTTCTAGAGCTACGAAAATATTTGCCAAAATATTATGGCATCTGGTCACCTCCCACTGCACCAA  106

Query  371  ACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTAAAGATAGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  ACGATTTATACCTAAAACTGGAAGATGTGACCCATAAATTTAATAAGCCCTGTATAATGGATGTAAAGATAGGG  180

Query  445  CAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATTAATGGAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CAAAAAAGCTATGATCCTTTTGCCTCATCTGAGAAGATTCAGCAACAGGTCAGCAAGTACCCATTAATGGAAGA  254

Query  519  GATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAAACCAGCATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  GATTGGGTTCTTGGTGCTTGGCATGAGGGTTTATCATGTTCATTCCGATAGCTATGAGACAGAAAACCAGCATT  328

Query  593  ACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTACTGCTTAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  ACGGAAGAAGCTTAACAAAAGAAACTATAAAGGATGGAGTCTCCAGATTTTTTCATAATGGGTACTGCTTAAGA  402

Query  667  AAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAAGCAGCTTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  AAAGATGCTGTTGCTGCCAGTATTCAGAAGATTGAGAAAATTCTGCAGTGGTTTGAAAACCAGAAGCAGCTTAA  476

Query  741  TTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGAATGACAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  TTTTTACGCAAGTTCATTACTCTTTGTTTATGAAGGTTCATCTCAGCCAACCACTACAAAATTGAATGACAGAA  550

Query  815  CTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAATAACTTTCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  CTTTGGCAGAAAAGTTTTTGTCCAAAGGACAACTGTCAGACACAGAAGTACTAGAGTACAATAATAACTTTCAT  624

Query  889  GTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTATGCGCGTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  GTGTTAAGTTCCACAGCTAATGGAAAAATAGAGTCTTCAGTGGGCAAAAGCTTGTCCAAGATGTATGCGCGTCA  698

Query  963  CAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAGACAATGGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  CAGGAAAATATATACAAAAAAGCATCACAGTCAGACTTCATTGAAAGTTGAAAATCTGGAGCAAGACAATGGGT  772

Query 1037  GGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTACCATCTTCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  GGAAAAGCATGTCACAGGAACATTTAAATGGAAATGTACTTTCCCAACTGGAAAAAGTTTTCTACCATCTTCCC  846

Query 1111  ACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAGCAACACAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  ACTGGTTGCCAAGAGATTGCTGAAGTAGAAGTGCGAATGATAGATTTTGCTCATGTGTTCCCTAGCAACACAAT  920

Query 1185  AGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  AGATGAGGGATATGTTTATGGGCTAAAGCATTTAATTTCTGTACTTCGAAGTATTTTAGACAAT  984