Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15331
• Subject: XM_017021902.1
• Aligned Length: 1251
• Identities: 772
• Gaps: 477

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATGCACGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCTGGCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTTTGACC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCAGTAAA  444
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGCCAGTAAA  11

Query  445  ATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGAGGACT  518
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  --------------------------------------------AGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGAGGACT  41

Query  519  CAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAGTGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  CAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAGTGGCC  115

Query  593  TGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTATTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTATTGAT  189

Query  667  GACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCAGATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCAGATGC  263

Query  741  TCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGTGATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  TCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGTGATCT  337

Query  815  CCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGAGACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  CCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGAGACTT  411

Query  889  ATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAACCTGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  ATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAACCTGGG  485

Query  963  CACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGATCCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  CACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGATCCTGG  559

Query 1037  AGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGGCGGTGTCTTTGATATTTCT  1110
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  AGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGGCGGTGTCTTTGATATTTCT  633

Query 1111  AATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTGATTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  AATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTGATTGA  707

Query 1185  TTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  TTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT  774