Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15373
• Subject: NR_040008.2
• Aligned Length: 2952
• Identities: 2071
• Gaps: 880

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GCTCTTCCTGGTTGGGCCCTGCCCTGAGCTGCCACCGGGAAGCCAGCCTCAGGGACTGCAGCGACCCCCAAACA  74

Query    1  -------------ATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGC  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCTCCCCCAGGATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGC  148

Query   62  AGCGGGCCAGGGAGCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCGGGCCAGGGAGCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTG  222

Query  136  CGGGTGCGATGCCTGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTA  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGTGCGATGCCTGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTA  296

Query  210  CAAGGACCTGGGTCCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCACGGAACTGCTGTCAAACC  283
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  297  CAAGGACCTGGGTCCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCAC-----------------  353

Query  284  CCCAGTTCATTGTGGATGGAGCTACCCGCACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGCTGGCTCTTGGCG  357
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  354  -----------------------------------------------------GGGGACTGCTGGCTCTTGGCG  374

Query  358  GCCATCGCCTCCCTCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGG  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  GCCATCGCCTCCCTCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGG  448

Query  432  CTATGCCGGCATCTTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGC  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  CTATGCCGGCATCTTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGC  522

Query  506  CCATCAAGGACGGGAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAG  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  CCATCAAGGACGGGAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAG  596

Query  580  GCCTATGCCAAGGTAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCAC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  GCCTATGCCAAGGTAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCAC  670

Query  654  AGGCGGGGTTACCGAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGG  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  AGGCGGGGTTACCGAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGG  744

Query  728  AGCGGGGCTCCCTGCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAG  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  AGCGGGGCTCCCTGCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAG  818

Query  802  TTGGTGAAGGGCCATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGAT  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TTGGTGAAGGGCCATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGAT  892

Query  876  CCGGATGCGGAACCCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACG  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  CCGGATGCGGAACCCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACG  966

Query  950  TGGACCCATATGAACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTC  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  TGGACCCATATGAACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTC  1040

Query 1024  ATGCGGGAGTTCACCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  ATGCGGGAGTTCACCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATG  1114

Query 1098  GAACACCACACTCTACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCT  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  GAACACCACACTCTACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCT  1188

Query 1172  TCTGGGTGAACCCTCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCA  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  TCTGGGTGAACCCTCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCA  1262

Query 1246  GGCTGCAGCTTCGTGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGAC  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GGCTGCAGCTTCGTGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGAC  1336

Query 1320  TATTGGCTTCGCGGTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCT  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  TATTGGCTTCGCGGTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCT  1410

Query 1394  TCCTGGCCAATGCGTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTG  1467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  TCCTGGCCAATGCGTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTG  1484

Query 1468  CCACCCGGGGAGTATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTT  1541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  CCACCCGGGGAGTATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTT  1558

Query 1542  CTCAGAGAAGAGTGCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCT  1615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  CTCAGAGAAGAGTGCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCT  1632

Query 1616  CAGAAGAGGAGATTGACGAGAACTTCAATGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTG  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  CAGAAGAGGAGATTGACGAGAACTTCAAGGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTG  1706

Query 1690  AAGGAGTTGCGGACAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGA  1763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  AAGGAGTTGCGGACAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGA  1780

Query 1764  GTCGTGCCGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCC  1837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  GTCGTGCCGCAGCATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCC  1854

Query 1838  TGTGGAACCGCATCCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCC  1911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  TGTGGAACCGCATCCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCC  1928

Query 1912  TACGAGATGCGGATGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCG  1985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  TACGAGATGCGGATGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCG  2002

Query 1986  CTACTCGGAGCCCGACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCC  2059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  CTACTCGGAGCCCGACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCC  2076

Query 2060  GATTTTTCAAAACTCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACC  2133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  GATTTTTCAAAACTCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACC  2150

Query 2134  ATGTTTGCA-----------------------------------------------------------------  2142
            |||||||||                                                                 
Sbjct 2151  ATGTTTGCATGAGGCAGGGACTCGGTCCCCCTTGCCGTGCTCCCCTCCCTCCTCGTCTGCCAAGCCTCGCCTCC  2224

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2225  TACCACACCACACCAGGCCACCCCAGCTGCAAGTGCCTTCCTTGGAGCAGAGAGGCAGCCTCGTCCTCCTGTCC  2298

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2299  CCTCTCCTCCCAGCCACCATCGTTCATCTGCTCCGGGCAGAACTGTGTGGCCCCTGCCTGTGCCAGCCATGGGC  2372

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2373  TCGGGATGGACTCCCTGGGCCCCACCCATTGCCAAGCCAGGAAGGCAGCTTTCGCTTGTTCCTGCCTCGGGACA  2446

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2447  GCCCCGGGTTTCCCCAGCATCCTGATGTGTCCCCTCTCCCCACTTCAGAGGCCACCCACTCAGCACCACCGGCC  2520

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2521  TGGCCTTGCCTGCAGACTATAAACTATAACCACTAGCTCGACACAGTCTGCAGTCCAGGCGTGTGGAGCCGCCT  2594

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2595  CCCGGCTCGGGGAGGCCCCGGGGCTGGGAACGCCTGTGCCTTCCTGCGCCGAAGCCAACGCCCCCTCTGTCCTT  2668

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2669  CCCTGGCCCTGCTGCCGACCAGGAGCTGCCCAGCCTGTGGGCGGTCGGCCTTCCCTCCTTCGCTCCTTTTTTAT  2742

Query 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142
                                                                                      
Sbjct 2743  ATTAGTGATTTTAAAGGGGACTCTTCAGGGACTTGTGTACTGGTTATGGGGGTGCCAGAGGCACTAGGCTTGGG  2816

Query 2143  ------------------------------------------------------------------  2142
                                                                              
Sbjct 2817  GTGGGGAGGTCCCGTGTTCCATATAGAGGAACCCCAAATAATAAAAGGCCCCACATCTGTCTGTGA  2882