Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15385
- Subject:
- XM_017313060.1
- Aligned Length:
- 1470
- Identities:
- 1295
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC 74
|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1 ATGCATCACTGTAAGCGATACCGTTCCCCAGAGCCAGACCCATACCTGAGCTACCGCTGGAAGAGGAGGCGGTC 74
Query 75 CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA 148
.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 TTACAGTCGGGAGCATGAAGGTCGACTACGATACCCATCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGGAGATCACGGTCCA 148
Query 149 GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG 222
||||||||||.||..|.|||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 149 GAAGCCATGATCGTATACCCTACCAGCGGAGGTACCGGGAACACCGTGACAGTGATACGTATCGGTGTGAAGAG 222
Query 223 CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG 296
|||||||||||.|||||||||||||.||||||..|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.|||||||.
Sbjct 223 CGGAGCCCATCTTTTGGAGAGGACTGCTATGGGTCTTCACGTTCTCGACATCGGAGACGGTCACGAGAGAGGGC 296
Query 297 GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297 GCCGTACCGTACCCGCAAGCATGCCCACCACTGTCACAAACGCCGTACCAGGTCTTGTAGCAGTGCTTCCTCGA 370
Query 371 GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGCCACCTGGTGTGCCGGATC 444
Query 445 GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATG------------------------------------------------- 469
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATCGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG 518
Query 470 --------------------AGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG 523
||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCACAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGTAATGTGGGCAAGTATCGGGAAGCTG 592
Query 524 CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG 597
|.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct 593 CTCGTCTAGAAATTAATGTTCTCAAGAAAATCAAGGAGAAAGACAAGGAAAATAAGTTCCTTTGTGTCCTGATG 666
Query 598 TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT 671
||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGACTGGTTCAACTTCCATGGTCATATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT 740
Query 672 GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA 745
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 741 GAAGGAGAACAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGTCATGCCCTTA 814
Query 746 GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT 819
|||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTTCTACACGAGAACCAGCTGACCCACACAGACTTGAAGCCAGAGAACATCTTGTTTGTGAATTCTGAGTTT 888
Query 820 GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT 893
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGCGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCAGACTT 962
Query 894 TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA 967
||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 963 TGGCAGTGCCACGTTTGACCATGAACATCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTACCGCCCACCTGAGGTGA 1036
Query 968 TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC 1041
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGATGTCTGGAGTATCGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGTGGC 1110
Query 1042 TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC 1115
||.|||||||||||||||||.|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111 TTTACACTCTTCCAGACCCATGAAAATAGAGAACACTTGGTTATGATGGAGAAGATTCTAGGACCCATCCCATC 1184
Query 1116 ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG 1189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTGGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG 1258
Query 1190 ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG 1263
|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 ATGGGCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTGCAGGACTCCCTGGAGCATGTGCAG 1332
Query 1264 CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA 1337
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||.||.|||.|||||||
Sbjct 1333 CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAGTTCGACCCTGCTCAGCGCATCACATTGGCAGAAGCCTTGCTGCA 1406
Query 1338 CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct 1407 CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACAGCAGCCGTAACCCCAGCAGA 1470