Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15398
• Subject: XM_006528023.3
• Aligned Length: 1627
• Identities: 1358
• Gaps: 110

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------ATGGCGGATGC-  11
                                                                          |.|.|  ||.| 
Sbjct    1  ATGCAGAAGCCACGTGGAGAACCCGAAGGGAAGCCAACACGTGCTAGAGTCATTTACCAGCCAAGCC--ATCCT  72

Query   12  -------GG-------AAGTAATTATTTTGCCAAAGAAACATAAGAAGAAAAAGGAGCGGAAGTCATTGCCAGA  71
                   ||       ||.||||||..||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.|.|||
Sbjct   73  AGTGTTTGGCCTCACAAACTAATTACATTCCCAAAGAAGCATAAGAAGAAAAAAGACCGGAAGCCATTACAAGA  146

Query   72  AGAAGATGTAGCCGAAATACAACACGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCTGAATCCAAAGTTGCTAAGTTGGACA  145
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|.||.||||
Sbjct  147  AGATGATGTTGCCGAAATACAACATGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCAGAATCTAAAGTGGCTCAATTAGACA  220

Query  146  CGTCTCAGTGGCCCCTTTTGCTAAAGAATTTTGATAAGCTGAATGTAAGGACAACACACTATACACCTCTTGCA  219
            |.||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|.
Sbjct  221  CTTCTCAGTGGCCCTTGTTACTAAAGAATTTTGATAAGCTAAATGTAAGGACAGCACACTATACACCTCTTCCT  294

Query  220  TGTGGTTCAAATCCTCTGAAGAGAGAGATTGGGGACTATATCAGGACAGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTC  293
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  TGTGGTTCAAATCCTCTGAAGAGGGAGATTGGGGACTATATCAGGACCGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTC  368

Query  294  TAACCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATTCGACGGATACTTCGGGTGGAGAAGACAGGGCACAGTGGTA  367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  369  TAACCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATCCGACGAATACTTCGGGTAGAGAAGACTGGCCACAGTGGCA  442

Query  368  CTCTGGATCCCAAGGTGACTGGTTGTTTAATCGTGTGCATAGAACGAGCCACTCGCTTGGTGAAGTCACAACAG  441
            |.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  443  CACTAGATCCCAAAGTGACTGGTTGTTTAATTGTGTGCATTGAACGAGCCACTCGTTTGGTGAAATCACAACAG  516

Query  442  AGTGCAGGCAAAGAGTATGTGGGGATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGGACCCAGCTTTCTAGGGC  515
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  517  AGTGCAGGCAAAGAGTATGTTGGAATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGTACTCAGCTTTCTAGGGC  590

Query  516  CCTAGAAACTCTGACAGGTGCCTTATTCCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTCCGAGTGA  589
            ||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  591  CCTAGAAACTCTGACAGGTGCCCTGTTTCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTTCGAGTGA  664

Query  590  GGACCATCTACGAGAGCAAAATGATTGAATACGATCCTGAAAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTGAGTTGTGAG  663
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  665  GGACTATCTACGAGAGCAAAATGATAGAATATGATCCTGAGAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTAAGCTGTGAA  738

Query  664  GCTGGCACCTACATTCGGACATTATGTGTGCACCTTGGTTTGTTATTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAGCT  737
            |||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  739  GCTGGCACCTACATTCGGACACTATGCGTACACCTTGGCTTGTTACTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAACT  812

Query  738  TCGGAGGGTTCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTGCTTGATGCTCAGT  811
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  813  TCGGAGGGTGCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTACTCGATGCTCAGT  886

Query  812  GGCTGTATGATAACCACAAGGATGAGAGTTACCTGCGGCGATTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCT  885
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GGCTGTATGATAACCATAAGGATGAGAGTTACTTGCGGCGTGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCT  960

Query  886  CATAAACGGCTGGTTATGAAAGACAGTGCAGTAAATGCCATCTGCTATGGGGCCAAGATTATGCTTCCAGGTGT  959
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|
Sbjct  961  CATAAACGTCTGGTTATGAAAGATAGTGCAGTGAATGCAATCTGCTATGGGGCCAAGATCATGCTTCCTGGTCT  1034

Query  960  TCTTCGATATGAGGACGGCATTGAGGTCAATCAGGAGATTGTGGTTATCACCACCAAAGGAGAAGCAATCTGCA  1033
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1035  TCTTCGATATGAAGATGGCATTGAGGTCAACCAGGAGATTGTGGTCATTACTACTAAGGGGGAAGCTATCTGCA  1108

Query 1034  TGGCTATTGCATTAATGACCACAGCGGTCATCTCTACCTGCGACCATGGTATAGTAGCCAAGATCAAGAGAGTG  1107
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1109  TGGCAATTGCATTGATGACTACAGCAGTGATTTCTACCTGTGACCATGGTATAGTAGCCAAAATAAAGAGGGTG  1182

Query 1108  ATCATGGAGAGAGACACTTACCCTCGGAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGCTGATGATCAA  1181
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1183  ATCATGGAGAGAGACACTTATCCTCGCAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGATGATGATCAA  1256

Query 1182  GCAGGGCCTTCTGGACAAGCATGGGAAGCCCACAGACAGCACACCTGCCACCTGGAAGCAGGAGTATGTTGACT  1255
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..||.||||||||.|||||.|||||.||..||||||
Sbjct 1257  GCAGGGCCTTCTGGACAAGCATGGCAAACCCACAGACAATACCCCTGCCACATGGAAACAGGATTACATTGACT  1330

Query 1256  ACAGTGAGTCTGCCAA-AAAAGAGGTGGTTGCTGAAGTGGTAAAAGCCCCGCAGGTAGTTGCCGAAGCAG----  1324
            |.|||||.||||.||| ||.|.| .|||||.|.||||..|||.|||||||.|||.|||.|||.|||||||    
Sbjct 1331  ATAGTGATTCTGGCAAGAACACA-CTGGTTACCGAAGCAGTACAAGCCCCTCAGTTAGCTGCTGAAGCAGTAAA  1403

Query 1325  ---CAAAAACTGCGAAGCGGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGAAAGTGACGAGACTCCTCCAGCAGCTCCTCAGTTG  1395
               ||.|||     ||  |||||||.||.|||||||||||||||||.||||   |.|||.|||.|||.||||| 
Sbjct 1404  TGTCATAAA-----AA--GGAAGCGGGATAGTGAGAGTGAAAGTGATGAGA---CCCCAACAGTTCCCCAGTT-  1466

Query 1396  ATCAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGTAAGAAGGACAAGAAGGCCAAAGCTGGTCTGGAGAGCGGGGCCGAGCCTGG  1469
                 ||||||||||||||||   ||||||||.||||||.|||||.|||..||.||.||.||||.|||..||||
Sbjct 1467  -----GAAGGAAAAGAAGAAG---AAGAAGGATAAGAAGCCCAAAACTGTGCTAGAAAGTGGGGGCGAAACTGG  1532

Query 1470  AGATGGGGACAGTGATACCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAAAGAGGTAGAATTGGTTTCTGAG  1542
            |||||||||||..||.||||||   ||.|||||.|||||||||||||.|||||.|||||||..|.|.|||||.
Sbjct 1533  AGATGGGGACAACGACACCACC---AAAAAGAAAAAGAAGAAGAAAGTAAAAGTGGTAGAAGAGATGTCTGAA  1602