Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15412
• Subject: XM_024452181.1
• Aligned Length: 1965
• Identities: 1697
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296

Query  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370

Query  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444

Query  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518

Query  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592

Query  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666

Query  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740

Query  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGA---------------------  793

Query  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC  888
                                                                                      
Sbjct  794  --------------------------------------------------------------------------  793

Query  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962
                                                                                      
Sbjct  794  --------------------------------------------------------------------------  793

Query  963  CGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATCTTG  1036
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  -----------------------------------------------GACCCATGGATGAAGGACCAGATCTTG  820

Query 1037  ATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGACAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  ATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGACAGT  894

Query 1111  GTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCAACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  GTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCAACC  968

Query 1185  CATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACCCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  CATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACCCAC  1042

Query 1259  CCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  CCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTTGCT  1116

Query 1333  CGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACCACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  CGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACCACT  1190

Query 1407  CCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191  CCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAG  1264

Query 1481  GAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265  GAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCT  1338

Query 1555  GGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1339  GGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGT----  1408

Query 1629  GGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTG  1702
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409  -----------------------------------------------GTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTG  1435

Query 1703  GTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436  GTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGT  1509

Query 1777  GGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510  GGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCC  1583

Query 1851  TGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584  TGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGG  1657

Query 1925  ATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1965
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658  ATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1698