Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15413
- Subject:
- XR_001779874.1
- Aligned Length:
- 2441
- Identities:
- 1801
- Gaps:
- 511
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CGCGCCTGCGCAGTGCGGCGCCTAGGGGGAACGCGAGAAGGAGACGGACGTTGAGAGAACGAGGAGGAAGGCGA 74
Query 1 ----ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCC 70
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCC 148
Query 71 AGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACT 144
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 AGCCAACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACT 222
Query 145 GATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCC 218
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 GATGTCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCC 296
Query 219 TCCCACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGG 274
||||||| |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TCCCACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGG 370
Query 275 GGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCT 348
|.|||||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 371 GATATGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACT 444
Query 349 GCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGA 422
|||||||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 445 GCATATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGA 518
Query 423 TGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATG 496
|||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGTAACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATG 592
Query 497 GACAGAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTAC 570
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 593 GACAGAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTAT 666
Query 571 CCTCCTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGG 644
||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTCCTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGG 740
Query 645 GCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTT 718
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 GCAGCCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTT 814
Query 719 ACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAG 792
||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCCCCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAG 888
Query 793 AGTTCATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGG 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTTCATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGG 962
Query 867 AGAGAACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCA 940
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAGAACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCA 1036
Query 941 GAGGTGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCC 1014
|||||||||||||||||||||||||||||.||| ||||||
Sbjct 1037 GAGGTGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGG-----------------------------------GGACCC 1075
Query 1015 ATGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTA 1088
|||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 ATGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTA 1149
Query 1089 TGTACAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGA 1162
|||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1150 TGTGCAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGA 1223
Query 1163 TGAACAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCC 1236
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1224 TGAACAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCC 1297
Query 1237 ACAGTGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAG 1310
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1298 ACAGTGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAG 1371
Query 1311 CAAACTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGG 1384
||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||
Sbjct 1372 CAAACTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGG 1445
Query 1385 GCAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATG 1458
||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1446 GCAGGGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATG 1519
Query 1459 GGAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGG 1532
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1520 GGAGGCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGG 1593
Query 1533 AGGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGA 1606
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1594 AGGAAATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGA 1667
Query 1607 GAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGT 1680
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1668 GAACAGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGT 1741
Query 1681 GATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGG 1754
||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1742 GATCGTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGG 1815
Query 1755 AATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTG 1828
||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1816 AATGTTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTG 1889
Query 1829 GTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGA 1902
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1890 GTGGAGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGA 1963
Query 1903 CGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC----------- 1965
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1964 CGTGGAGGACCTGGGAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTACTAGAGACCTGC 2037
Query 1966 -------------------------------------------------------------------------- 1965
Sbjct 2038 AGAGCTGCATTGACGACCAGATTTATTTTTTAAACCAGAAAATGTTTTAAATTTATAATTCCATATTTATAATG 2111
Query 1966 -------------------------------------------------------------------------- 1965
Sbjct 2112 TTGGCGACAACATTATGATTATTCCTTGTCTGTACTTTAGTATTTTCACCATTTGTGAAGAAACATTAAAACAA 2185
Query 1966 -------------------------------------------------------------------------- 1965
Sbjct 2186 GTTAAATAGTAGTGTGCTGAGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGATTTGTTCTTTTTTTTTTCCTTTTTAA 2259
Query 1966 -------------------------------------------------------------------------- 1965
Sbjct 2260 GATGGTTGTTTTAAGACTTAACAATGGGAACCCCTTGTGAGCATGCTCAGTATCATTGTGGAGAACCAAGAGGG 2333
Query 1966 ------------------------------------------------------------------------- 1965
Sbjct 2334 CCTCTAATTGTAACAATGTTCATGGTTGTGATTTTTTTTTTTAAATAAAATTCCAAATGTTTATAAACTGTCA 2406
