Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15421
• Subject: NM_001271470.1
• Aligned Length: 1157
• Identities: 952
• Gaps: 124

Alignment

Query    1  ATGTCCCTGGTAGATTTGGGAAAGAAGCTTTTAGAAGCGGCACGAGCAGGTCAAGATGATGAAGTTCGTATTTT  74
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGGTAGATTTGGGGAAGAAGCTTTTAGAAGCGGCACGAGCCGGTCAAGATGATGAAGTTCGCATTTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGAGCTCCCTTTACTACAGACTGGCTGGGAACTTCTCCACTTCATCTAGCAGCACAGTATGGTC  148
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GATGGCAAATGGAGCTCCTTTTACTACAGACTGGTTGGGAACTTCTCCACTTCATCTGGCCGCACAGTATGGGC  148

Query  149  ATTATTCCACCACAGAGGTACTGCTGCGAGCTGGTGTGAGCAGAGATGCCAGAACCAAAGTGGACCGAACACCA  222
            |||..||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATTTCTCTACCACAGAGGTTCTTCTCCGAGCCGGTGTAAGTAGAGATGCCAGGACCAAAGTGGACCGGACACCA  222

Query  223  TTACATATGGCAGCTTCTGAGGGCCATGCCAGCATAGTAGAGGTTTTACTTAAGCATGGTGCTGATGTCAATGC  296
            .|.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  CTGCACATGGCGGCTTCTGAGGGCCATGCCAACATAGTAGAAGTTTTGCTTAAGCATGGTGCTGACGTCAATGC  296

Query  297  AAAGGACATGTTAAAGATGACAGCTCTCCATTGGGCCACAGAACACAATCATCAAGAGGTGGTGGAACTTTTAA  370
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  AAAGGATATGTTAAAGATGACAGCTCTGCATTGGGCAACAGAACATAATCATCAAGAGGTGGTGGAGCTTTTAA  370

Query  371  TCAAATATGGTGCTGATGTACACACGCAAAGTAAATTTTGTAAAACTGCATTTGATATTTCAATAGACAATGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAATATGGTGCTGATGTACACACGCAGAGTAAATTTTGTAAAACTGCATTTGATATTTCAATAGACAATGGA  444

Query  445  AATGAAGATTTAGCAGAGATATTACAGATTGCTATGCAGAACCAAATCAACACAAACCCAGAGAGTCCTGACAC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  AATGAAGATTTAGCAGAGATATTACAGATTGCTATGCAGAACCAAATCAACACCAACCCGGAGAGTCCTGACAC  518

Query  519  TGTGACAATACATGCTGCAACACCACAGTTTATCATTGGACCTGGAGGGGTGGTGAACCTAACAGATGAAACGG  592
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  TGTGACAATACACGCTGCCACACCACAGTTCATCATTGGACCCGGAGGGGTGGTGAACCTCACAGATGAAACAG  592

Query  593  GTGTATCTGCTGTTCAGTTTGGAAACTCTTCTACATCAGTATTAGCTACATTAGCTGCCTTAGCTGAAGCATCT  666
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  GAGTATCTGCTGTTCAGTTTGGAAACTCCTCTACGTCAGTATTAGCTACGTTAGCTGCCTTAGCTGAAGCTTCT  666

Query  667  GCTCCATTGTCCAATTCTTCAGAAACTCCAGTAGTGGCCACAGAAGAAGTAGTTACTGCAGAATCTGTGGATGG  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCCATTGTCCAATTCTTCAGAAACTCC---AGTGGCCACAGAGGAAGTGGTTACCGCAGAATCTGTGGATGG  737

Query  741  TGCCATTCAGCAAGTAGTTAGTTCAGGGGGTCAGCAAGTCATCGCAATAGTTACAGATGGAATTCAGCTTGGAA  814
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  738  TGCAATTCAGCAAGTAGTTAGCTCAGGGGGTCAGCAAGTCATCACGATAGTTACAGATGGAATCCAGCTGGGGA  811

Query  815  ATTTGCACTCTATTCCAACCAGTGGAATTGGTCAGCCCATCATTGTGACCATGCCAGATGGACAACAAGTATTA  888
            ||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  812  ATTTGCACTCCATACCAACCAGTGGGATGGGTCAGCCCATCATTGTGACGATGCCCGATGGACAGCAAGTATTG  885

Query  889  ACAGTACCAGCAACAGACATTGCTGAAGAAACTGTTATAAGTGAAGAACCACCAGCTAAGAGACAATGTATCGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  886  ACAGTACCAGCAACAGACATTGCTGAAGAAACTGTCATCAGTGAAGAGCCACCAGCTAAGAGACAGTGTATGGA  959

Query  963  AATAATTGAAAACCGGGTGGAATCTGCAGAAATAGAAG-AGAGAGAAGCTCTTCAGA-AACAGCTG------GA  1028
            |||||||||.|.|||||||||||.|||||||||.|||| |   ||.||| |||   | |.|.|.||      |.
Sbjct  960  AATAATTGAGAGCCGGGTGGAATGTGCAGAAATTGAAGTA---AGGAGC-CTT---ATACCCGGTGTGTTTTGC  1026

Query 1029  TGAAGCAAATCGAGAAGCACAAAAATATCGACAGCAGCTCCTAAAGAAAGAACAGGAAGCAGAGGCCTACAGAC  1102
            ||.||| .|||        |||||                                                  
Sbjct 1027  TGCAGC-CATC--------CAAAA--------------------------------------------------  1041

Query 1103  AGAAGTTGGAAGCTATGACTCGTCTTCAGACTAATAAAGAAGCTGTT  1149
                                                           
Sbjct 1042  -----------------------------------------------  1041