Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15425
• Subject: NM_008091.3
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1192
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGACGGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCACCACCCCGCCGTGCTCAACGGGCAGCACCCGGA  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAGGTGACTGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCATCACCCCGCGGTCCTCAACGGTCAGCACCCAGA  74

Query   75  CACGCACCACCCGGGCCTCAGCCACTCCTACATGGACGCGGCGCAGTACCCGCTGCCGGAGGAGGTGGATGTGC  148
            |||||||||||||||||||.||||.||.||||||||   .||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|
Sbjct   75  CACGCACCACCCGGGCCTCGGCCATTCGTACATGGA---AGCTCAGTATCCGCTGACGGAAGAGGTGGACGTAC  145

Query  149  TTTTTAACATCGACGGTCAAGGCAACCACGTCCCGCCCTACTACGGAAACTCGGTCAGGGCCACGGTGCAGAGG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  146  TTTTTAACATCGATGGTCAAGGCAACCACGTCCCGTCCTACTACGGAAACTCCGTCAGGGCTACGGTGCAGAGG  219

Query  223  TACCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTGTGCCGCCCGCCTCTGCTTCATGGATCCCTACCCTGGCTGGACGG  296
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  220  TATCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTATGCCGCCCGCCTCTGCTGCACGGATCTCTGCCCTGGCTGGATGG  293

Query  297  CGGCAAAGCCCTGGGCAGCCACCACACCGCCTCCCCCTGGAATCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC  370
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CGGCAAAGCCCTGAGCAGCCACCACACCGCCTCGCCCTGGAACCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC  367

Query  371  ACGGCTCCCCGGGGCCCCTCTCCGTCTACCCCCCGGCCTCGTCCTCCTCCTTGTCGGGGGGCCACGCCAGCCCG  444
            |||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||..||.|||..||||||.||||.||.
Sbjct  368  ACGGCTCTCCGGGGCCTCTGTCCGTTTACCCTCCGGCTTCATCCTCTTCTCTGGCGGCCGGCCACTCCAGTCCT  441

Query  445  CACCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAGGACGTCTCCCCGGACCCATCGCTGTCCACCCCAGGCTCGGC  518
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  442  CATCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAAGACGTCTCCCCAGACCCGTCGCTGTCCACCCCGGGATCCGC  515

Query  519  CGGCTCGGCCCGGCAGGACGAGAAAGAGTGCCTCAAGTACCAGGTGCCCCTGCCCGACAGCATGAAGCTGGAGT  592
            |||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct  516  CGGGTCGGCCAGGCAAGATGAGAAAGAGTGCCTCAAGTATCAGGTGCAGCTGCCAGATAGCATGAAGCTGGAGA  589

Query  593  CGTCCCACTCCCGTGGCAGCATGACCGCCCTGGGTGGAGCCTCCTCGTCGACCCACCACCCCATCACCACCTAC  666
            ||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct  590  CGTCTCACTCTCGAGGCAGCATGACCACCCTGGGTGGGGCCTCATCCTCAGCCCACCACCCCATTACCACCTAT  663

Query  667  CCGCCCTACGTGCCCGAGTACAGCTCCGGACTCTTCCCCCCCAGCAGCCTGCTGGGCGGCTCCCCCACCGGCTT  740
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  664  CCGCCCTATGTGCCCGAGTACAGCTCTGGACTCTTCCCACCCAGCAGCCTGCTGGGAGGATCCCCTACCGGGTT  737

Query  741  CGGATGCAAGTCCAGGCCCAAGGCCCGGTCCAGCAC---AGGCAGGGAGTGTGTGAACTGTGGGGCAACCTCGA  811
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||   |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  738  CGGATGTAAGTCGAGGCCCAAGGCACGATCCAGCACAGAAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGCGGGGCAACCTCTA  811

Query  812  CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGCACGGGACACTACCTGTGCAACGCCTGCGGGCTCTATCACAAAATGAACGGA  885
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct  812  CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGTACCGGGCACTACCTTTGCAATGCCTGCGGACTCTACCATAAAATGAATGGG  885

Query  886  CAGAACCGGCCCCTCATTAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCTGCAGCCAGGAGAGCAGGGACGTCCTGTGCGAACTG  959
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  CAGAACCGGCCCCTTATCAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCGGCAGCAAGGAGAGCAGGGACATCCTGCGCGAACTG  959

Query  960  TCAGACCACCACAACCACACTCTGGAGGAGGAATGCCAATGGGGACCCTGTCTGCAATGCCTGTGGGCTCTACT  1033
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  960  TCAGACCACCACCACCACCCTCTGGAGGAGGAACGCTAATGGGGACCCGGTCTGCAATGCCTGTGGGCTGTACT  1033

Query 1034  ACAAGCTTCACAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAGGAAGGCATCCAGACCAGAAACCGAAAAATGTCT  1107
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1034  ACAAGCTTCATAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAAGAAGGCATCCAGACCCGAAACCGGAAGATGTCT  1107

Query 1108  AGCAAATCCAAAAAGTGCAAAAAAGTGCATGACTCACTGGAGGACTTCCCCAAGAACAGCTCGTTTAACCCGGC  1181
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||
Sbjct 1108  AGCAAATCGAAAAAGTGCAAAAAGGTGCATGACGCGCTGGAGGACTTCCCCAAGAGCAGCTCCTTCAACCCGGC  1181

Query 1182  CGCCCTCTCCAGACACATGTCCTCCCTGAGCCACATCTCGCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACGC  1255
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1182  CGCTCTCTCCAGACACATGTCATCCCTGAGCCACATCTCTCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACAC  1255

Query 1256  CCACGCCGATGCACCCGCCATCCAGCCTGTCCTTTGGACCACACCACCCCTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT  1329
            |.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  CGACGCCCATGCATCCGCCCTCCGGCCTCTCCTTCGGACCTCACCACCCTTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT  1329