Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15439
• Subject: NM_002103.5
• Aligned Length: 2211
• Identities: 2019
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGACTGGGAGGATGAATTCGACCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGACTGGGAGGATGAATTCGACCTGGA  74

Query   75  GAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCTGGGAGGTGGCTAACAAGGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTGCAGACGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCTGGGAGGTGGCTAACAAGGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTGCAGACGA  148

Query  149  AGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCTGGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCTGGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGG  222

Query  223  ACCCAGGTGGAACTGCTGGAGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAGGGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCCAGGTGGAACTGCTGGAGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAGGGCTG  296

Query  297  CA------------------------------------------------------------------------  298
            ||                                                                        
Sbjct  297  CAAGGTGTATTTCGGGCGCTGGCTGATCGAGGGAGGCCCTCTGGTGGTGCTCCTGGACGTGGGTGCCTCAGCTT  370

Query  299  --------------------------------------------------------------------------  298
                                                                                      
Sbjct  371  GGGCCCTGGAGCGCTGGAAGGGAGAGCTCTGGGATACCTGCAACATCGGAGTGCCGTGGTACGACCGCGAGGCC  444

Query  299  ----------------------------------------------AGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCC  326
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACGACGCTGTCCTCTTTGGCTTTCTGACCACCTGGTTCCTGGGTGAGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCC  518

Query  327  ACATGTGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGTCGTGCCCGGCGACTGCCTG  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACATGTGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGTCGTGCCCGGCGACTGCCTG  592

Query  401  TAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAAC  474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAAC  666

Query  475  AACCTGGAGAACTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATCTACCACCGATACTGCATGGAAAGGGC  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCTGGAGAACTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATCTACCACCGATACTGCATGGAAAGGGC  740

Query  549  GGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTTCACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTTCACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA  814

Query  623  GGAAACCAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAGAAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTC  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAAACCAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAGAAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTC  888

Query  697  CATGCTCAGAGCAAGGCTCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGCATCTGGACTTCAACTTGGA  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGCTCAGAGCAAGGCTCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGCATCTGGACTTCAACTTGGA  962

Query  771  CAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTATGAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCAT  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTATGAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCAT  1036

Query  845  TGGCTCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGGTTGCCTTCTTCATCATGCCAGCG  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCTCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGGTTGCCTTCTTCATCATGCCAGCG  1110

Query  919  CGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACCCTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGGACACGGCCAACAC  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACCCTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGGACACGGCCAACAC  1184

Query  993  GGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGGTTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGC  1066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGGTTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGC  1258

Query 1067  TGGATAAGGAAGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGCGGCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGC  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGATAAGGAAGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGCGGCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGC  1332

Query 1141  ACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAGACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAG  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAGACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAG  1406

Query 1215  TGCCGACAGGGTGAAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTCCACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATG  1288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCGACAGGGTGAAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTCCACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATG  1480

Query 1289  AGGAGTTTGTCCGTGGCTGTCACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGCTGAG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGTTTGTCCGTGGCTGTCACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGCTGAG  1554

Query 1363  TGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCTCTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGC  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCTCTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGC  1628

Query 1437  AGACCCCTCAGCTTACGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCCTGCTCGCAGCTCA  1510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACCCCTCAGCTTACGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCCTGCTCGCAGCTCA  1702

Query 1511  CCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAGCCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTC  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAGCCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTC  1776

Query 1585  TCCGACCTTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGTACTATATGTCTGCGCGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTT  1658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCGACCTTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGTACTATATGTCTGCGCGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTT  1850

Query 1659  TCCAGAGCACTTCACCTACGAGCCCAACGAGGCGGATGCGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGCCAGCCTCGG  1732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCCAGAGCACTTCACCTACGAGCCCAACGAGGCGGATGCGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGCCAGCCTCGG  1924

Query 1733  TGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCACCAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGG  1806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCACCAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGG  1998

Query 1807  CCGCTGGAGGAAGACGGCGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCCGTGCACC  1880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCGCTGGAGGAAGACGGCGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCCGTGCACC  2072

Query 1881  AGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGCAGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCT  1954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGCAGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCT  2146

Query 1955  CCAGCTCACTCAGCACCCCGAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC  2019
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCAGCTCACTCAGCACCCCGAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC  2211