Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15456
• Subject: XM_011536718.2
• Aligned Length: 2559
• Identities: 1904
• Gaps: 654

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCCCGTGTTCGGGCGGGGACGGCTCCACCCCTCCTGGGCCCTCCCTTCGGGACAGGGACTGTCCCGCCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGTGCTGAATACCCGCGCGACCGTCTGGATCCCCGCCCAGGAAGCCCCTCTGAAGCCTCCTCGCCGCCGTTTC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGAGAAGGGCACCTGTTAACTGGTACCAAGAAAAGGCCCAAGTGTTTCTCTGGCATCTGATGGTGTCTGGATCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACCACTCTACTCTGTCTCTGGAAACAGCCCTTCCACGTCTCTGCATTCCCTGTCACCGCGTCACTGGCCTTCAG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ACAGAGCCAAGGTGCAGGGCAACACCTCTACAAGGATCTGCAGCCATTTATATTGCTTAGGCTACTGATGCCTG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  AGGAAACCCAGACCCAAGACCAACCGATGGAGGAGGAGGAGGTTGAGACGTTCGCCTTTCAGGCAGAAATTGCC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  CAGTTGATGTCATTGATCATCAATACTTTCTACTCGAACAAAGAGATCTTTCTGAGAGAGCTCATTTCAAATTC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  ATCAGATGCATTGGACAAAATCCGGTATGAAAGCTTGACAGATCCCAGTAAATTAGACTCTGGGAAAGAGCTGC  592

Query    1  --------------------------------------------------------------ATGACCAAGGCT  12
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  593  ATATTAACCTTATACCGAACAAACAAGATCGAACTCTCACTATTGTGGATACTGGAATTGGAATGACCAAGGCT  666

Query   13  GACTTGATCAATAACCTTGGTACTATCGCCAAGTCTGGGACCAAAGCGTTCATGGAAGCTTTGCAGGCTGGTGC  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTTGATCAATAACCTTGGTACTATCGCCAAGTCTGGGACCAAAGCGTTCATGGAAGCTTTGCAGGCTGGTGC  740

Query   87  AGATATCTCTATGATTGGCCAGTTCGGTGTTGGTTTTTATTCTGCTTATTTGGTTGCTGAGAAAGTAACTGTGA  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATATCTCTATGATTGGCCAGTTCGGTGTTGGTTTTTATTCTGCTTATTTGGTTGCTGAGAAAGTAACTGTGA  814

Query  161  TCACCAAACATAACGATGATGAGCAGTACGCTTGGGAGTCCTCAGCAGGGGGATCATTCACAGTGAGGACAGAC  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACCAAACATAACGATGATGAGCAGTACGCTTGGGAGTCCTCAGCAGGGGGATCATTCACAGTGAGGACAGAC  888

Query  235  ACAGGTGAACCTATGGGTCGTGGAACAAAAGTTATCCTACACCTGAAAGAAGACCAAACTGAGTACTTGGAGGA  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGGTGAACCTATGGGTCGTGGAACAAAAGTTATCCTACACCTGAAAGAAGACCAAACTGAGTACTTGGAGGA  962

Query  309  ACGAAGAATAAAGGAGATTGTGAAGAAACATTCTCAGTTTATTGGATATCCCATTACTCTTTTTGTGGAGAAGG  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACGAAGAATAAAGGAGATTGTGAAGAAACATTCTCAGTTTATTGGATATCCCATTACTCTTTTTGTGGAGAAGG  1036

Query  383  AACGTGATAAAGAAGTAAGCGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGACAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAG  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACGTGATAAAGAAGTAAGCGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGACAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAG  1110

Query  457  AAAGAGTCGGAAGACAAACCTGAAATTGAAGATGTTGGTTCTGATGAGGAAGAAGAAAAGAAGGATGGTGACAA  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGAGTCGGAAGACAAACCTGAAATTGAAGATGTTGGTTCTGATGAGGAAGAAGAAAAGAAGGATGGTGACAA  1184

Query  531  GAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGGAAAAGTACATCGATCAAGAAGAGCTCAACAAAACAAAGCCCATCTGGACCA  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGGAAAAGTACATCGATCAAGAAGAGCTCAACAAAACAAAGCCCATCTGGACCA  1258

Query  605  GAAATCCCGACGATATTACTAATGAGGAGTACGGAGAATTCTATAAGAGCTTGACCAATGACTGGGAAGATCAC  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAAATCCCGACGATATTACTAATGAGGAGTACGGAGAATTCTATAAGAGCTTGACCAATGACTGGGAAGATCAC  1332

Query  679  TTGGCAGTGAAGCATTTTTCAGTTGAAGGACAGTTGGAATTCAGAGCCCTTCTATTTGTCCCACGACGTGCTCC  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGGCAGTGAAGCATTTTTCAGTTGAAGGACAGTTGGAATTCAGAGCCCTTCTATTTGTCCCACGACGTGCTCC  1406

Query  753  TTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAATATCAAATTGTATGTACGCAGAGTTTTCATCATGGATA  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAACATCAAATTGTATGTACGCAGAGTTTTCATCATGGATA  1480

Query  827  ACTGTGAGGAGCTAATCCCTGAATATCTGAACTTCATTAGAGGGGTGGTAGACTCGGAGGATCTCCCTCTAAAC  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTGTGAGGAGCTAATCCCTGAATATCTGAACTTCATTAGAGGGGTGGTAGACTCGGAGGATCTCCCTCTAAAC  1554

Query  901  ATATCCCGTGAGATGTTGCAACAAAGCAAAATTTTGAAAGTTATCAGGAAGAATTTGGTCAAAAAATGCTTAGA  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATATCCCGTGAGATGTTGCAACAAAGCAAAATTTTGAAAGTTATCAGGAAGAATTTGGTCAAAAAATGCTTAGA  1628

Query  975  ACTCTTTACTGAACTGGCGGAAGATAAAGAGAACTACAAGAAATTCTATGAGCAGTTCTCTAAAAACATAAAGC  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACTCTTTACTGAACTGGCGGAAGATAAAGAGAACTACAAGAAATTCTATGAGCAGTTCTCTAAAAACATAAAGC  1702

Query 1049  TTGGAATACACGAAGACTCTCAAAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTAAGGTACTACACATCTGCCTCTGGT  1122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGGAATACACGAAGACTCTCAAAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTAAGGTACTACACATCTGCCTCTGGT  1776

Query 1123  GATGAGATGGTTTCTCTCAAGGACTACTGCACCAGAATGAAGGAGAACCAGAAACATATCTATTATATCACAGG  1196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGAGATGGTTTCTCTCAAGGACTACTGCACCAGAATGAAGGAGAACCAGAAACATATCTATTATATCACAGG  1850

Query 1197  TGAGACCAAGGACCAGGTAGCTAACTCAGCCTTTGTGGAACGTCTTCGGAAACATGGCTTAGAAGTGATCTATA  1270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAGACCAAGGACCAGGTAGCTAACTCAGCCTTTGTGGAACGTCTTCGGAAACATGGCTTAGAAGTGATCTATA  1924

Query 1271  TGATTGAGCCCATTGATGAGTACTGTGTCCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGGAAGACTTTAGTGTCAGTCACC  1344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGATTGAGCCCATTGATGAGTACTGTGTCCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGGAAGACTTTAGTGTCAGTCACC  1998

Query 1345  AAAGAAGGCCTGGAACTTCCAGAGGATGAAGAAGAGAAAAAGAAGCAGGAAGAGAAAAAAACAAAGTTTGAGAA  1418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAAGAAGGCCTGGAACTTCCAGAGGATGAAGAAGAGAAAAAGAAGCAGGAAGAGAAAAAAACAAAGTTTGAGAA  2072

Query 1419  CCTCTGCAAAATCATGAAAGACATATTGGAGAAAAAAGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGATTGGTGACAT  1492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTCTGCAAAATCATGAAAGACATATTGGAGAAAAAAGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGATTGGTGACAT  2146

Query 1493  CTCCATGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGCTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGCTCAAGCCCTA  1566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCCATGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGCTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGCTCAAGCCCTA  2220

Query 1567  AGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAACCCTGACCATTCCATTATTGA  1640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAACCCTGACCATTCCATTATTGA  2294

Query 1641  GACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGATAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTGCTTTATGAAA  1714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGATAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTGCTTTATGAAA  2368

Query 1715  CTGCGCTCCTGTCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACACATGCTAACAGGATCTACAGGATGATCAAA  1788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTGCGCTCCTGTCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACACATGCTAACAGGATCTACAGGATGATCAAA  2442

Query 1789  CTTGGTCTGGGTATTGATGAAGATGACCCTACTGCTGATGATACCAGTGCTGCTGTAACTGAAGAAATGCCACC  1862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTTGGTCTGGGTATTGATGAAGATGACCCTACTGCTGATGATACCAGTGCTGCTGTAACTGAAGAAATGCCACC  2516

Query 1863  CCTTGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  1905
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCTTGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  2559