Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15503
- Subject:
- NM_002471.3
- Aligned Length:
- 1939
- Identities:
- 1797
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 MGDSEMAVFGAAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDLKKDVFVPDDKQEFVKAKIVSREGGKVTAETEYGKTVTVKED 74
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Sbjct 1 MTDAQMADFGAAAQYLRKSEKERLEAQTRPFDIRTECFVPDDKEEFVKAKILSREGGKVIAETENGKTVTVKED 74
Query 75 QVMQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLYNLKDRYGSWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYTPEVVAAYRGKKRS 148
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Sbjct 75 QVLQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLFNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNAEVVAAYRGKKRS 148
Query 149 EAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFAVIAAIGDRSKKDQ-SPGKGTLEDQII 221
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Sbjct 149 EAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFASIAAIGDRGKKDNANANKGTLEDQII 222
Query 222 QANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVIFQLKAERDYHIFYQILSNKKP 295
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Sbjct 223 QANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVIFQLKAERNYHIFYQILSNKKP 296
Query 296 ELLDMLLITNNPYDYAFISQGETTVASIDDAEELMATDNAFDVLGFTSEEKNSMYKLTGAIMHFGNMKFKLKQR 369
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Sbjct 297 ELLDMLLVTNNPYDYAFVSQGEVSVASIDDSEELMATDSAFDVLGFTSEEKAGVYKLTGAIMHYGNMKFKQKQR 370
Query 370 EEQAEPDGTEEADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQNVQQVIYATGALAKAVYERMFNWMVTRI 443
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Sbjct 371 EEQAEPDGTEDADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQSVQQVYYSIGALAKAVYEKMFNWMVTRI 444
Query 444 NATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDL 517
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Sbjct 445 NATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDL 518
Query 518 QACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLFDNHLGKSANFQKPRNIKGKPEAHFSLIHYAGIVDYNII 591
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Sbjct 519 QACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLYDNHLGKSNNFQKPRNIKGKQEAHFSLIHYAGTVDYNIL 592
Query 592 GWLQKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSTLFANYAGAD-APIEKGKGKAKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRS 664
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Sbjct 593 GWLEKNKDPLNETVVALYQKSSLKLMATLFSSYATADTGDSGKSKGGKKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRT 666
Query 665 THPHFVRCIIPNETKSPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPAAIPEGQFIDS 738
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Sbjct 667 THPHFVRCIIPNERKAPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPVAIPEGQFIDS 740
Query 739 RKGAEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRIQAQSRGVLARMEYKKLLERRDSLL 812
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Sbjct 741 RKGTEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRMQAQARGQLMRIEFKKIVERRDALL 814
Query 813 VIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAEREKEMASMKEEFTRLKEALEKSEARRKELEEKMVSLLQEKND 886
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Sbjct 815 VIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFGRIKETLEKSEARRKELEEKMVSLLQEKND 888
Query 887 LQLQVQAEQDNLADAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKRDIDDLELT 960
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Sbjct 889 LQLQVQAEQDNLNDAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELT 962
Query 961 LAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQAEEDKVNTLTKAKVKLEQQVDDL 1034
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Sbjct 963 LAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQVEEDKVNSLSKSKVKLEQQVDDL 1036
Query 1035 EGSLEQEKKVRMDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKQQLDERLKKKDFELNALNARIEDEQALGSQLQKKL 1108
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Sbjct 1037 EGSLEQEKKVRMDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKLQLEEKLKKKEFDINQQNSKIEDEQVLALQLQKKL 1110
Query 1109 KELQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEAT 1182
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Sbjct 1111 KENQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEAT 1184
Query 1183 LQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDDVTSNMEQIIKAKANLEKMCRTLEDQM 1256
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Sbjct 1185 LQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDDVTSNMEQIIKAKANLEKVSRTLEDQA 1258
Query 1257 NEHRSKAEETQRSVNDLTSQRAKLQTENGELSRQLDEKEALISQLTRGKLTYTQQLEDLKRQLEEEVKAKNALA 1330
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Sbjct 1259 NEYRVKLEEAQRSLNDFTTQRAKLQTENGELARQLEEKEALISQLTRGKLSYTQQMEDLKRQLEEEGKAKNALA 1332
Query 1331 HALQSARHDCDLLREQYEEETEAKAELQRVLSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEAV 1404
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Sbjct 1333 HALQSARHDCDLLREQYEEETEAKAELQRVLSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEAV 1406
Query 1405 EAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLS 1478
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Sbjct 1407 EAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLS 1480
Query 1479 TELFKLKNAYEESLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGSSGKTIHELEKVRKQLEAEKMELQSALEEAEASLE 1552
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Sbjct 1481 TELFKLKNAYEESLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGEGGKNVHELEKVRKQLEVEKLELQSALEEAEASLE 1554
Query 1553 HEEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHLRVVDSLQTSLDAETRSRNEALRVKKKMEGDLNEME 1626
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Sbjct 1555 HEEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHQRVVDSLQTSLDAETRSRNEVLRVKKKMEGDLNEME 1628
Query 1627 IQLSHANRMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVVEQTERSRK 1700
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Sbjct 1629 IQLSHANRMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVVEQTERSRK 1702
Query 1701 LAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMDADLSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQD 1774
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Sbjct 1703 LAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMESDLTQLQSEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQD 1776
Query 1775 TSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELENELEAEQKRNAESVKGMRKSERRIK 1848
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Sbjct 1777 TSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELEGELEAEQKRNAESVKGMRKSERRIK 1850
Query 1849 ELTYQTEEDRKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRA 1922
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Sbjct 1851 ELTYQTEEDKKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRA 1924
Query 1923 KSRDIGTK-GLNEE- 1935
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Sbjct 1925 KSRDIGAKQKMHDEE 1939