Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15511
• Subject: NM_001252260.1
• Aligned Length: 885
• Identities: 762
• Gaps: 51

Alignment

Query   1  ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC  74
           ||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||                 
Sbjct   1  ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTC-----------------  57

Query  75  CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG  148
                                 |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  58  ----------------------GTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG  109

Query 149  GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222
           |.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 110  GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  183

Query 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 184  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT  257

Query 297  CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG  370
           ||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 258  CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG  331

Query 371  AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT  444
           ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 332  AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT  405

Query 445  AGCAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA  515
           |.|||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||   |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 406  AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA  473

Query 516  TGATGAAGATGATGATGGTGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAATCTATAC  589
           ||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||.|||
Sbjct 474  TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC  547

Query 590  GAGATACTCCAGCCAAAAATGCACAAAAGTCAAATCAGAATGGAAAAGACTCAAAACCATCATCAACACCAAGA  663
           |||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||||   ||||||||||.|||
Sbjct 548  GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAAC---CATCAACACCGAGA  618

Query 664  TCAAAAGGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA  737
           |||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619  TCAAAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA  692

Query 738  CATTAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATT  811
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 693  CATTAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATT  766

Query 812  GTGTGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT  882
           .||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 767  ATGTGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT  837