Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15515
• Subject: NM_001003941.3
• Aligned Length: 1281
• Identities: 1281
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTCATTTAAGGACTTGTGCTGCTAAGTTGAGGCCATTGACGGCTTCCCAGACTGTTAAGACATTTTCACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTCATTTAAGGACTTGTGCTGCTAAGTTGAGGCCATTGACGGCTTCCCAGACTGTTAAGACATTTTCACA  74

Query   75  AAACAGACCAGCAGCAGCTAGGACATTTCAACAGATTCGGTGCTATTCTGCACCTGTTGCTGCTGAGCCCTTTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACAGACCAGCAGCAGCTAGGACATTTCAACAGATTCGGTGCTATTCTGCACCTGTTGCTGCTGAGCCCTTTC  148

Query  149  TCAGTGGGACTAGTTCGAACTATGTGGAGGAGATGTACTGTGCTTGGCTGGAAAACCCCAAAAGTGTACATAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGTGGGACTAGTTCGAACTATGTGGAGGAGATGTACTGTGCTTGGCTGGAAAACCCCAAAAGTGTACATAAG  222

Query  223  TCATGGGACATTTTTTTTCGCAACACGAATGCCGGAGCCCCACCGGGCACTGCCTACCAGAGTCCCCTTCCCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATGGGACATTTTTTTTCGCAACACGAATGCCGGAGCCCCACCGGGCACTGCCTACCAGAGTCCCCTTCCCCT  296

Query  297  GAGCCGAGGCTCCCTGGCTGCTGTGGCCCATGCACAGTCCCTGGTAGAAGCACAGCCCAACGTGGACAAGCTCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGCCGAGGCTCCCTGGCTGCTGTGGCCCATGCACAGTCCCTGGTAGAAGCACAGCCCAACGTGGACAAGCTCG  370

Query  371  TGGAGGACCACCTGGCAGTGCAGTCGCTCATCAGGGCATATCAGATACGAGGGCACCATGTAGCACAGCTGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAGGACCACCTGGCAGTGCAGTCGCTCATCAGGGCATATCAGATACGAGGGCACCATGTAGCACAGCTGGAC  444

Query  445  CCCCTGGGGATTTTGGATGCTGATCTGGACTCCTCCGTGCCCGCTGACATTATCTCATCCACAGACAAACTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCCTGGGGATTTTGGATGCTGATCTGGACTCCTCCGTGCCCGCTGACATTATCTCATCCACAGACAAACTTGG  518

Query  519  GTTCTATGGCCTGGATGAGTCTGACCTCGACAAGGTCTTCCACTTGCCCACCACCACTTTCATCGGGGGACAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCTATGGCCTGGATGAGTCTGACCTCGACAAGGTCTTCCACTTGCCCACCACCACTTTCATCGGGGGACAGG  592

Query  593  AATCAGCACTTCCTCTGCGGGAGATCATCCGTCGGCTGGAGATGGCCTACTGCCAGCATATTGGGGTGGAGTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATCAGCACTTCCTCTGCGGGAGATCATCCGTCGGCTGGAGATGGCCTACTGCCAGCATATTGGGGTGGAGTTC  666

Query  667  ATGTTCATCAATGACCTGGAGCAGTGCCAGTGGATCCGGCAGAAGTTTGAGACCCCTGGGATCATGCAGTTCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGTTCATCAATGACCTGGAGCAGTGCCAGTGGATCCGGCAGAAGTTTGAGACCCCTGGGATCATGCAGTTCAC  740

Query  741  AAATGAGGAGAAACGGACCCTGCTGGCCAGGCTTGTGCGGTCCACCAGGTTTGAGGAGTTCCTACAGCGGAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAATGAGGAGAAACGGACCCTGCTGGCCAGGCTTGTGCGGTCCACCAGGTTTGAGGAGTTCCTACAGCGGAAGT  814

Query  815  GGTCCTCTGAGAAGCGCTTTGGTCTAGAAGGCTGCGAGGTACTGATCCCTGCCCTCAAGACCATCATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTCCTCTGAGAAGCGCTTTGGTCTAGAAGGCTGCGAGGTACTGATCCCTGCCCTCAAGACCATCATTGACAAG  888

Query  889  TCTAGTGAGAATGGCGTGGACTACGTGATCATGGGCATGCCACACAGAGGGCGGCTGAACGTGCTTGCAAATGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTAGTGAGAATGGCGTGGACTACGTGATCATGGGCATGCCACACAGAGGGCGGCTGAACGTGCTTGCAAATGT  962

Query  963  CATCAGGAAGGAGCTGGAACAGATCTTCTGTCAATTCGATTCAAAGCTGGAGGCAGCTGATGAGGGCTCCGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCAGGAAGGAGCTGGAACAGATCTTCTGTCAATTCGATTCAAAGCTGGAGGCAGCTGATGAGGGCTCCGGAG  1036

Query 1037  ATGTGAAGTACCACCTGGGCATGTATCACCGCAGGATCAATCGTGTCACCGACAGGAACATTACCTTGTCCTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTGAAGTACCACCTGGGCATGTATCACCGCAGGATCAATCGTGTCACCGACAGGAACATTACCTTGTCCTTG  1110

Query 1111  GTGGCCAACCCTTCCCACCTTGAGGCCGCTGACCCCGTGGTGATGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGTTTTACTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGGCCAACCCTTCCCACCTTGAGGCCGCTGACCCCGTGGTGATGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGTTTTACTG  1184

Query 1185  TGGCGACACTGAAGGGAAAAAGGTAAGGCCCAGAGAGAGGCGTGCAAGGCAGATCGTCAAGGCCCCATGTTCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCGACACTGAAGGGAAAAAGGTAAGGCCCAGAGAGAGGCGTGCAAGGCAGATCGTCAAGGCCCCATGTTCCA  1258

Query 1259  GCATGGAGTTCCGCTCACCAACA  1281
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCATGGAGTTCCGCTCACCAACA  1281