Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15559
• Subject: NM_001347530.1
• Aligned Length: 633
• Identities: 528
• Gaps: 57

Alignment

Query   1  ATGCAGGCCATCAAGTGTGTGGTGGTGGGAGACGGAGCTGTAGGTAAAACTTGCCTACTGATCAGTTACACAAC  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct   1  ATGCAGGCCATCAAGTGTGTGGTGGTGGGAGACGGAGCTGTTGGTAAAACCTGCCTGCTCATCAGTTACACGAC  74

Query  75  CAATGCATTTCCTGGAGAATATATCCCTACTGTCTTTGACAATTATTCTGCCAATGTTATGGTAGATGGAAAAC  148
           ||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAATGCATTTCCTGGAGAGTACATCCCCACCGTCTTTGACAACTATTCTGCCAATGTTATGGTAGATGGAAAAC  148

Query 149  CGGTGAATCTGGGCTTATGGGATACAGCTGGACAAGAAGATTATGACAGATTACGCCCCCTATCCTATCCGCAA  222
           |.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 149  CAGTGAATCTGGGCCTATGGGACACAGCTGGACAAGAAGATTATGACAGATTGCGTCCCCTCTCCTACCCGCAG  222

Query 223  ACA---------------------------------------------------------GATGTGTTCTTAAT  239
           |||                                                         ||.|||||||||||
Sbjct 223  ACAGTTGGAGACACATGTGGTAAAGATAGACCCTCCAGGGGCAAAGACAAGCCGATTGCCGACGTGTTCTTAAT  296

Query 240  TTGCTTTTCCCTTGTGAGTCCTGCATCATTTGAAAATGTCCGTGCAAAGTGGTATCCTGAGGTGCGGCACCACT  313
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 297  TTGCTTTTCCCTTGTGAGTCCTGCATCATTTGAAAATGTCCGTGCAAAGTGGTATCCTGAAGTGCGACACCACT  370

Query 314  GTCCCAACACTCCCATCATCCTAGTGGGAACTAAACTTGATCTTAGGGATGATAAAGACACGATCGAGAAACTG  387
           |||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 371  GTCCCAATACTCCTATCATCCTCGTGGGGACGAAGCTTGATCTTAGGGATGATAAGGACACCATTGAGAAGCTG  444

Query 388  AAGGAGAAGAAGCTGACTCCCATCACCTATCCGCAGGGTCTAGCCATGGCTAAGGAGATTGGTGCTGTAAAATA  461
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 445  AAGGAGAAGAAGCTGACTCCCATCACCTACCCGCAGGGGCTGGCCATGGCGAAAGAGATCGGTGCTGTCAAATA  518

Query 462  CCTGGAGTGCTCGGCGCTCACACAGCGAGGCCTCAAGACAGTGTTTGACGAAGCGATCCGAGCAGTCCTCTGCC  535
           ||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 519  CCTGGAGTGCTCAGCTCTCACACAGCGAGGACTCAAGACAGTGTTTGACGAAGCTATCCGAGCGGTTCTCTGTC  592

Query 536  CGCCTCCCGTGAAGAAGAGGAAGAGAAAATGCCTGCTGTTG  576
           |.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CCCCTCCTGTCAAGAAGAGGAAGAGAAAATGCCTGCTGTTG  633