Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15561
- Subject:
- NM_001176528.1
- Aligned Length:
- 1377
- Identities:
- 1259
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGTACGAGAGTGTAGAAGTGGGGGG------TCCCACCCCTAATCCCTTCCTAGTGGTGGATTTTTATAACCA 68
||||||||||||||.|||||.||||| .|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGTACGAGAGTGTGGAAGTCGGGGGCCTTACCCCCGCCCCTAACCCCTTCCTAGTGGTGGACTTTTATAACCA 74
Query 69 GAACCGGGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGGCTCCCCGCCCCGGGTCCGTACTCCACCCCGCTCCGGACTCCGC 142
||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GAACCGGGCCTGTTTGCTCCAGGAGAAGGGGCTCCCTGCCCCGGGTCCCTACTCCACCCCACTCCGGACTCCGC 148
Query 143 TTTGGAATGGCTCAAACCACTCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCG 216
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 TTTGGAATGGCTCAAACCACTCCATCGAGACCCAGAGCAGCAGTTCCGAAGAGATAGTACCCAGCCCTCCCTCA 222
Query 217 CCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGT 290
|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CCACCGCCCCTGCCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTTTGTCAAGACAAATCATCCGGCTACCACTATGGGGT 296
Query 291 CAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGG 364
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CAGCGCCTGTGAGGGCTGTAAGGGCTTCTTCCGACGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTATACGTGTCACCGGG 370
Query 365 ACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTG 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 371 ACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTG 444
Query 439 GGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGA 512
|||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GGCATGTCCAAGGAGTCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGA 518
Query 513 GAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTG 586
||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 519 GAGCTACACGCTGACGCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGG 592
Query 587 CCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGG 660
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGG 666
Query 661 GACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCAC 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCAC 740
Query 735 CACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCA 808
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 741 CACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCA 814
Query 809 CGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAAC 882
|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 CGCGGTACACGCCTGAGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAAC 888
Query 883 GCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGC 956
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 GCTGGCTTTGGCCCCCTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGC 962
Query 957 GGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGG 1030
.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||
Sbjct 963 TGAGACTGGACTGCTCAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGG 1036
Query 1031 ACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATG 1104
||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 ACATGCTGCAAGAGCCGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATG 1110
Query 1105 TTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCT 1178
||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|
Sbjct 1111 TTCCCCAAGATGCTGATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATT 1184
Query 1179 GAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTC 1252
|||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1185 GAAGATGGAGATCCCAGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTC 1258
Query 1253 TGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGC 1326
|.|||||||||.|||||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 TAAGCGGACAGTCGGGGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGC 1332
Query 1327 CTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG 1371
|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1333 CTCAGTCCCAGCTCCCACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA 1377