Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15561
• Subject: XM_006532597.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 943
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGTACGAGAGTGTAGAAGTGGGGGGTCCCACCCCTAATCCCTTCCTAGTGGTGGATTTTTATAACCAGAACCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGGCTCCCCGCCCCGGGTCCGTACTCCACCCCGCTCCGGACTCCGCTTTGGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGCTCAAACCACTCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGA  370
                                                          ||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGTGTATACGTGTCACCGGGACAAGA  28

Query  371  ACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct   29  ACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTGGGCATG  102

Query  445  TCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTA  518
            |||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  103  TCCAAGGAGTCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGAGAGCTA  176

Query  519  CACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCT  592
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  177  CACGCTGACGCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGGCCCTCT  250

Query  593  GCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAG  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  GCCAGCTGGGCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGGGACAAG  324

Query  667  TTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  325  TTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCACCACCCT  398

Query  741  CACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGT  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  399  CACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCACGCGGT  472

Query  815  ACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGC  888
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  473  ACACGCCTGAGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAACGCTGGC  546

Query  889  TTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGAC  962
            ||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  547  TTTGGCCCCCTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGCTGAGAC  620

Query  963  GGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGC  1036
            .||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||||||||
Sbjct  621  TGGACTGCTCAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGGACATGC  694

Query 1037  TGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCC  1110
            ||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  695  TGCAAGAGCCGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATGTTCCCC  768

Query 1111  AAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGAT  1184
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  769  AAGATGCTGATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATTGAAGAT  842

Query 1185  GGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCG  1258
            |||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct  843  GGAGATCCCAGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTCTAAGCG  916

Query 1259  GACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGC  1332
            |||||.|||||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  917  GACAGTCGGGGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGT  990

Query 1333  CCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1371
            |||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  991  CCCAGCTCCCACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA  1029