Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15561
- Subject:
- XM_011525095.1
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1298
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 --------------------ATGTACGAGA-GTGTAGAAGTGGGGGGTCCCACCCCTAA-----------TCCC 42
.||..|||.| .|| |.||.||| ||||.| || |.||
Sbjct 1 ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTG-----GGGGCGGG---CACCTC-AATGGGTACCCGGTGCC 65
Query 43 TTCCTAGTGGTGGATTTTTATAACCAGAACCGGGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGG------CTCCCCGCCCC 110
|.|||| .|..||.||.|..| ||..|.|||| ||| |||||||||..
Sbjct 66 TCCCTA----CGCCTTCTTCTTCC----------CCCCTATGCT----------GGGTGGACTCTCCCCGCCAG 115
Query 111 GGGTCCGTACT--CCAC---CCCGCTCCGGACTCCGCTT--TGGA-ATGGCTCAAACCA--------CTCCATT 168
| ||..|| |||| ||.||.||.|..|||..|| |||| ||.| ||.|||| |.|||||
Sbjct 116 G----CGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAGTTAGTGGATATAG--CACACCATCCCCAGCCACCATT 183
Query 169 GAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAA 257
Query 243 GCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCT 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 GCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCT 331
Query 317 TCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTG 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 TCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTG 405
Query 391 ACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAA 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 ACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAA 479
Query 465 CGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGG 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGG 553
Query 539 GGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACT 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 GGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACT 627
Query 613 ACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAA 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 ACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAA 701
Query 687 GTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCA 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCA 775
Query 761 CCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACC 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACC 849
Query 835 ATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCT 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCT 923
Query 909 GGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCT 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 GGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCT 997
Query 983 GCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAG 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 GCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAG 1071
Query 1057 GCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTAC 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTAC 1145
Query 1131 TGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGC 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 TGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGC 1219
Query 1205 CGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGG 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 CGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGG 1293
Query 1279 CGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAG 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 CGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAG 1367
Query 1353 CCCGGCCACCCACTCCCCG 1371
|||||||||||||||||||
Sbjct 1368 CCCGGCCACCCACTCCCCG 1386