Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15588
• Subject: NM_001166356.2
• Aligned Length: 1512
• Identities: 1482
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGCTGTACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTACTTCTCTTTGTTTTGGGCGGCTCGGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCG  74

Query   75  GGCTCAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTCAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGT  148

Query  149  CGGACAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGACAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATT  222

Query  223  GCCTCAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTCAGAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGG  296

Query  297  TTATCCTGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTATCCTGGCAAGAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCT  370

Query  371  TGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTG  444

Query  445  GCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCATCTCAC  518

Query  519  CCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCA  592

Query  593  ACCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATA  666
            ||                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AC------------------------------CTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATA  636

Query  667  GCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  GCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACA  710

Query  741  CCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  CCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGG  784

Query  815  ACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  ACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTG  858

Query  889  AAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  AAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCC  932

Query  963  ATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  ATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGCCTGCACCCCCA  1006

Query 1037  TGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  TGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTAC  1080

Query 1111  TCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  TCACTGGTATCAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCG  1154

Query 1185  GGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  GGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCA  1228

Query 1259  CACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  CACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTT  1302

Query 1333  GTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGCCAAGCTCCAGGATTTCAA  1376

Query 1407  ATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  ATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCA  1450

Query 1481  GGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  GGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCAT  1482